Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus (2019)
- Authors:
- Autor USP: SANTOS, LETÍCIA BONATO SOUZA - FM
- Unidade: FM
- Sigla do Departamento: MDT
- DOI: 10.11606/D.5.2019.tde-22082019-083951
- Subjects: FILOGENIA; GENES; GENÓTIPOS; FUNGOS MITOSPORICOS; BIOLOGIA MOLECULAR; ANÁLISE DE SEQUÊNCIA DE DNA
- Keywords: Genotype; Molecular typing; Multilocus sequence typing; Phylogeny; Tipagem de sequências multilocus; Tipagem molecular; Trichosporon
- Language: Português
- Abstract: Nas últimas décadas observou-se um número crescente de relatos de infecções invasivas por Trichosporon em ambientes hospitalares, devido ao aumento da população suscetível e a melhoria dos métodos diagnósticos. Leveduras do gênero Trichosporon, depois de Candida, são as mais relacionadas à infecção fúngica invasiva em pacientes hematológicos, sendo Trichosporon asahii responsável por 90% dos casos. A identificação de espécies de Trichosporon é realizada através do sequenciamento da região IGS1 do DNA ribossomal, técnica considerada padrão-ouro. Através do estudo dos polimorfismos da região IGS1 do DNA ribossomal, diversos genótipos de T. asahii têm sido descritos, entretanto sem relação com a distribuição geográfica, perfil de suscetibilidade aos antifúngicos ou patogenicidade. O presente estudo teve como objetivo padronizar um método de análise por sequenciamento multilocus para a espécie T. asahii, definindo novos genes (loci) para melhor descrever a filogenia da espécie. Foram analisadas 21 cepas de T. asahii de diferentes origens (Brasil, Europa, Ásia) e genótipos (1,3,4,5,6,7). As sequências de genes estruturais (housekeeping genes) dos genomas de T. asahii (CBS2479 e CBS8904) disponíveis no GenBank foram alinhadas e analisadas in silico para o delineamento e avaliação dos novos primers. Após as reações de PCR e análise das sequências de DNA, quatro novos loci foram selecionados para a análise filogenética multilocus: phosphate carrier protein, topoisomerase 1 (TOP1), beta-1-tubulin, copper-exporting ATPase. As árvores filogenéticas demonstraram dois clados bem distintos, com altos valores debootstraps. Além disso, os genótipos 1 e 3 foram alocados em clados diferentes. Nossos resultados sugerem uma reclassificação genética para a espécie T. asahii. Novos estudos, incluindo um maior número de cepas e outros marcadores genéticos, são necessários para melhor abordar a filogenia atual de T. asahii
- Imprenta:
- Data da defesa: 31.05.2019
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
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- Versão publicada (Published version)
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-
ABNT
SANTOS, Letícia Bonato Souza. Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5133/tde-22082019-083951/. Acesso em: 10 abr. 2026. -
APA
Santos, L. B. S. (2019). Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5133/tde-22082019-083951/ -
NLM
Santos LBS. Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus [Internet]. 2019 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5133/tde-22082019-083951/ -
Vancouver
Santos LBS. Análise filogenética da espécie Trichosporon asahii por sequenciamento multilocus [Internet]. 2019 ;[citado 2026 abr. 10 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5133/tde-22082019-083951/
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