Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae belonging to the endemic high-risk clonal group CG258 (2019)
- Authors:
- Autor USP: CERDEIRA, LOUISE TEIXEIRA - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- Subjects: ENGENHARIA GENÉTICA; GENÉTICA MICROBIANA; GENÔMICA
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A rápida disseminação de linhagens de Klebsiella pneumoniae resistentes aos carbapenêmicos, agrupadas dentro do grupo clonal GC258, e um crescente problema de saúde pública associado com infecções relacionadas a assistência a saúde. O objetivo deste estudo foi realizar uma análise genômica de cepas de K. pneumoniae produtoras de β-lactamases KPC-2 e/ou CTX-M, pertencentes ao GC258 (ST11, ST258, ST340, ST437), circulando na interface humana-ambiente-animal, no Brasil e na América do Sul. A análise foi direcionada para caracterizar o resistoma e viruloma, elementos genéticos de transferência e mobilização associados com a disseminação de genes ‘bla IND.KPC-2’, e realizar uma análise de genômica comparativa detalhada do GC258, com posterior avaliação da patogenicidade em modelo invertebrado (Galleria mellonella) de infecção, visando identificar biomarcadores de virulência. Os principais resultados são apresentados na forma de seis manuscritos. Manuscrito I: Nova sequência "draft" do genoma de K. pneumoniae 1194/11isolado de amostra clínica, pertencente ao ST340, mostrando um amplo resistoma. Manuscrito II: O reporte da primeira sequência "draft" do genoma de K. pneumoniae 606B (ST340), contendo ‘bla IND.CTX-M-15’ em animais de produção isolados no Brasil. Manuscrito III: O primeiro esboço da sequência do genoma de K. pneumoniae Kp171, recuperado de uma amostra de água coletada em um rio urbano no Brasil, demonstrando que atividades antrópicas, incluindo a liberação de esgoto e esgoto de hospitais, podem ter contribuído para a contaminação ambientes aquáticos, levantando uma preocupação para a saúde pública. Manuscripto IV: Identificação e análise de sequencia completa de um plasmídeo IncX3 portador de um elemento genético não Tn4401 (‘NTE IND.KPC’ ‘ANTPOT.-Ic’), originado de uma linhagem hospitalar associada a K. pneumoniae ST340, mostrando a dissemidisseminação de ‘bla IND.KPC-2’ no novo grupo Incompatibilidade. Manuscrito V: Disseminação de ‘bla IND.KPC-2’ no novo elemento non-Tn4401 (‘NTE IND.KPC’ ‘ANTPOT.-IId) portado por novos pequenos plasmídeos IncQ1 e Col-Like em linhagens de K. pneumoniae ST11 e ST340. Manuscrito VI: Os resultados obtidos no presente estudo permitem gerar um panorama genômico das linhagens de K. pneumoniae do GC258, circulando na interface humana-animal-ambiente, no Brasil e na América do Sul. De principal interesse, a convergência da virulência associada com genes codificando yersiniabactina e/ou a colibactina e a resistência a antibióticos clinicamente significativos (como carbapenemicos e polimixinas), estão contribuindo para o aparecimento de linhagens altamente virulentas e multirresistentes que apresentam um grande risco a saúde humana. Por outro lado, a ampla resistência aos antimicrobiana (antibióticos, desinfetantes e metais pesados) poderia estar contribuindo para a adaptação de estirpes de K. pneumoniae do GC258, produtoras de KPC-2- e/ou CTX-M, na interface humana-ambiente-animal, destacando a necessidade urgente de medidas para o controle de disseminação. Em conclusão, esses achados poderiam contribuir para o desenvolvimento de estratégias de prevenção, diagnóstico e tratamento das infecções por K. pneumoniae
- Imprenta:
- Data da defesa: 28.05.2019
-
ABNT
CERDEIRA, Louise Teixeira. Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae belonging to the endemic high-risk clonal group CG258. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-26082019-103040/. Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Cerdeira, L. T. (2019). Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae belonging to the endemic high-risk clonal group CG258 (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-26082019-103040/ -
NLM
Cerdeira LT. Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae belonging to the endemic high-risk clonal group CG258 [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-26082019-103040/ -
Vancouver
Cerdeira LT. Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae belonging to the endemic high-risk clonal group CG258 [Internet]. 2019 ;[citado 2025 dez. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-26082019-103040/ - Genomic features of a polymyxin-resistant Klebsiella pneumoniae ST491 isolate co-harbouring blaCTX-M-8 and qnrE1 genes from a hospitalised cat in São Paulo, Brazil
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