Identification of resistant sugarcane genotypes to ratoon stunt disease by Fourier-transform infrared analysis (2019)
- Authors:
- Autor USP: LABORDE, MARIE CAROLINE FERREIRA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LFN
- Subjects: BACTÉRIAS FITOPATOGÊNICAS; CANA-DE-AÇÚCAR; ESPECTROSCOPIA INFRAVERMELHA; GENÓTIPOS; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; RAQUITISMO DAS SOQUEIRAS; RESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETAL; TRANSFORMADA DE FOURIER
- Language: Inglês
- Abstract: O raquitismo da soqueira da cana (RS), causada pela bactéria Leifsonia xyli subsp. xyl (Lxx) pode produzir um impacto substancial negativo na produção de biomassa em todos os países produtores de cana-de-açúcar. Existem poucas opções de manejo para o controle da doença e todas são centradas em medidas de sanitização. Entretanto, este manejo não é eficiente, uma vez que não se elimina por completo a bactéria. Diante do exposto, uma alternativa interessante é a identificação e seleção de genótipos resistentes à doença. No entanto, por se tratar de um patossistema complexo, a seleção por métodos tradicionais não é viável em um programa de melhoramento. Uma nova abordagem é a identificação de genótipos resistentes por meio de técnica de espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier (FT-IR). Este estudo demonstrou que por meio da técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) foi possível quantificar os títulos bacterianos e determinar os níveis de resistência de dezenove variedades comerciais inoculadas com Lxx. Além disso, por meio da técnica de FT-IR foi possível distinguir genótipos resistentes de suscetíveis baseados em grupos químicos específicos. Por meio de um algoritmo não linear, support vector machine (SVM) e uma regressão linear, partial least square regression (PLSR), foi possível distinguir genótipos de cana-de-açúcar resistentes e suscetíveis à doença além de predizer a concentração de Lxx nos genótipos por meio de dados espectraise de título bacteriano. Nossos resultados demonstram que a resistência a esta doença está associada às variações bioquímicas e que os mecanismos de resistência envolvidos podem estar associados à regulação de poliaminas e ao acúmulo de compostos que tenha como principal grupo funcional anel aromático. Os resultados evidenciaram que ambas as abordagens, SVM e PLSR, foram capazes de fornecer estimativas precisas da resistência da cana-de-açúcar à RS e que a técnica FT-IR pode ser utilizada em programas de melhoramento na seleção de genótipos de cana-de-açúcar resistentes ao RS
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2019
- Data da defesa: 14.05.2019
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ABNT
LABORDE, Marie Caroline Ferreira. Identification of resistant sugarcane genotypes to ratoon stunt disease by Fourier-transform infrared analysis. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14082019-104403/. Acesso em: 11 out. 2025. -
APA
Laborde, M. C. F. (2019). Identification of resistant sugarcane genotypes to ratoon stunt disease by Fourier-transform infrared analysis (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14082019-104403/ -
NLM
Laborde MCF. Identification of resistant sugarcane genotypes to ratoon stunt disease by Fourier-transform infrared analysis [Internet]. 2019 ;[citado 2025 out. 11 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14082019-104403/ -
Vancouver
Laborde MCF. Identification of resistant sugarcane genotypes to ratoon stunt disease by Fourier-transform infrared analysis [Internet]. 2019 ;[citado 2025 out. 11 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-14082019-104403/
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