New strategies for implementing of genomic selection in breeding programs of clonally propagated crops (2019)
- Authors:
- Autor USP: BATISTA, LORENA GUIMARÃES - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; GENÔMICA; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; PROPAGAÇÃO VEGETAL; SELEÇÃO GENÉTICA
- Language: Inglês
- Abstract: A seleção genômica consiste no uso de efeitos preditos de marcadores genéticos para predizer os valores genéticos e/ou genotípicos de indivíduos genotipados. Desta forma, a seleção de genótipos superiores pode ser feita baseada apenas em valores genéticos preditos, reduzindo a necessidade de avaliações fenotípicas subsequentes. Isto representa um grande avanço em termos de custos e eficiência da seleção em programas de melhoramento de todos os tipos de culturas. No primeiro capítulo deste trabalho, nós exploramos uma das maneiras com que a seleção genômica pode ser utilizada para aumentar a eficiência no melhoramento simultâneo para múltiplos caráteres em espécies de propagação vegetativa. Utilizando simulações estocásticas, nós mostramos que um índice de seleção econômico deve ser utilizado no lugar da eliminação independente (independent culling). Os resultados mostram que o uso da seleção genômica pode tornar o custo-benefício da eliminação independente obsoleto se indivíduos em gerações iniciais forem genotipados e predições acuradas para todos os caráteres estiverem disponíveis desde o início. Apesar dos potenciais benefícios de realizar a seleção com base em valores genéticos preditos, para algumas espécies de propagação vegetativa a complexidade de seus genomas é um fator limitante para a efetiva implementação da seleção genômica em programas de melhoramento. Considerando que incluir a informação de dosagem alélica melhorou a performance de modelos de seleção genômicaem espécies autotetraploides, nosso objetivo no segundo capítulo deste trabalho foi avaliar a acurácia da predição genômica com informação de dosagem alélica em cana-de-açúcar, que é uma complexa espécie poliploide. Neste capítulo, nós expandimos modelos GBLUP de seleção genômica desenvolvidos para autotetraploides para incluir níveis mais altos de ploidia. Dois modelos foram utilizados, um modelo com somente efeitos aditivos e um modelo com efeitos aditivos e efeitos de dominância digênica. Nós observamos uma modesta melhora na performance do modelo preditivo quando estimativas de ploidia e dosagem alélica foram incluídas, indicando que esta é uma possível maneira de aprimorar a seleção genômica em cana-de-açúcar. Os resultados obtidos nos dois estudos podem auxiliar pesquisadores e melhoristas de espécies de propagação vegetativa, abrindo portas para novas pesquisas e indicando as maneiras mais eficientes para implementação da seleção genômica
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2019
- Data da defesa: 07.03.2019
-
ABNT
BATISTA, Lorena Guimarães. New strategies for implementing of genomic selection in breeding programs of clonally propagated crops. 2019. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-30072019-111124/. Acesso em: 25 jul. 2024. -
APA
Batista, L. G. (2019). New strategies for implementing of genomic selection in breeding programs of clonally propagated crops (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-30072019-111124/ -
NLM
Batista LG. New strategies for implementing of genomic selection in breeding programs of clonally propagated crops [Internet]. 2019 ;[citado 2024 jul. 25 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-30072019-111124/ -
Vancouver
Batista LG. New strategies for implementing of genomic selection in breeding programs of clonally propagated crops [Internet]. 2019 ;[citado 2024 jul. 25 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-30072019-111124/
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