Genomic studies in Passiflora edulis (Passifloraceae) (2018)
- Authors:
- Autor USP: COSTA, ZIRLANE PORTUGAL DA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: GENÔMICA; MARACUJÁ
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: Passiflora edulis, popularmente conhecido como maracujá azedo, é a espécie do gênero Passiflora mais cultivada, tendo importância econômica no Brasil tanto para a produção de suco industrializado quanto para o consumo da fruta fresca. Apesar da relevância da espécie, faltam pesquisas, principalmente nas áreas básicas. Para superar isso, nosso grupo tem realizado diversos estudos genéticos que incluem a estimativa dos níveis de polimorfismos moleculares, o estudo de locos quantitativos envolvidos no controle da produção e qualidade dos frutos e o mapeamento de genes de resistência à mancha bacteriana causada por Xanthomonas axonopodis. Além disso, para conhecer o genoma de P. edulis, foi construída uma biblioteca genômica inserida em BACs (82.944 clones, com cobertura de 6× do genoma haploide da espécie) que é mantida no CNRGV/INRA em Toulouse, França. Inicialmente, cerca de 10.000 BES (BAC-end sequences) foram sequenciadas, gerando aproximadamente 6,2 Mb de informação genômica, fornecendo a primeira visão do genoma de P. edulis sobre o conteúdo de genes e da porção repetitiva. Com o objetivo de obter informações mais completas, decidiu-se selecionar cerca de 100 insertos de BACs para o sequenciamento completo. A análise genômica realizada, especialmente a anotação estrutural e funcional dos genes e a identificação e caracterização dos elementos de transposição, constituíram os objetivos deste estudo. Os dados gerados pelo sequenciamento completo de 10.4 Mb de P. edulisrepresentam uma fonte rica de informações que foram exploradas nesta tese de doutorado
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2018
- Data da defesa: 31.10.2018
-
ABNT
COSTA, Zirlane Portugal da. Genomic studies in Passiflora edulis (Passifloraceae). 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-14032019-155108/. Acesso em: 02 ago. 2024. -
APA
Costa, Z. P. da. (2018). Genomic studies in Passiflora edulis (Passifloraceae) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-14032019-155108/ -
NLM
Costa ZP da. Genomic studies in Passiflora edulis (Passifloraceae) [Internet]. 2018 ;[citado 2024 ago. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-14032019-155108/ -
Vancouver
Costa ZP da. Genomic studies in Passiflora edulis (Passifloraceae) [Internet]. 2018 ;[citado 2024 ago. 02 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-14032019-155108/ - Desenvolvimento de marcadores SSR e SNP em maracujá-doce a partir de uma biblioteca enriquecida com genes de resposta à Xanthomonas axonopodis
- Correction to: Identification of passion fruit (Passiflora edulis) chromosomes using BAC-FISH
- Identification of passion fruit (Passiflora edulis) chromosomes using BAC-FISH
- Transposable element discovery and characterization of LTR-retrotransposon evolutionary lineages in the tropical fruit species Passiflora edulis
- A repertory of rearrangements and the loss of an inverted repeat region in Passiflora chloroplast genomes
- A genome sequence resource for the genus Passiflora, the genome of the wild diploid species Passiflora organensis
- The Passion Fruit Genome
- First investigation into the genetic control of meiosis in sugarcane
- Meiotic abnormalities in sugarcane Saccharum spp. and parental species: Evidence for peri‐ and paracentric inversions
- Evidence for strong kinship influence on the extent of linkage disequilibrium in cultivated common beans
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