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Adaptive or neutral clines? Integrating genome-wide clinal and seasonal variation to infer natural selection in Drosophila melanogaster (2018)

  • Authors:
  • Autor USP: RODRIGUES, MURILLO FERNANDO - IB
  • Unidade: IB
  • Sigla do Departamento: BIO
  • Subjects: DROSOPHILA; SELEÇÃO NATURAL; ADAPTAÇÃO; EVOLUÇÃO MOLECULAR
  • Keywords: Adaptação sazonal; Adaptation; Drosophila melanogaster; Drosophila melanogaster; Molecular variation; Natural selection; Seasonal adaptation; Variação molecular
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
  • Abstract: Variação espacial e temporal são ubíquas. Caracteres são chamados clinais quando variam ao longo de um gradiente ambiental, e isso é interpretado como resultado de seleção estruturada no espaço. Drosophila melanogaster apresenta clinas em diversos caracteres fenotípicos e genotípicos, as quais são replicadas em diferentes regiões do mundo. Estudos recentes sugeriram que grande parte da variação clinal pode ser atribuída a processos neutros. Como o ambiente varia de maneira similar com a latitude e ao longo do ano, e essa variação sazonal é ortogonal à demografia, uma abordagem possível para inferir seleção natural é integrar variação clinal e sazonal. Neste trabalho, nós testamos se há uma relação entre variação clinal e sazonal ao longo do genoma de D. melanogaster. Também, investigamos a proporção de variantes que deveriam estar sob seleção espacial e sazonal para explicar o padrão encontrado. Estimamos a frequência alélica a partir de amostras de pools de moscas coletadas em diferentes oito localidades ao longo da costa leste dos Estados Unidos e em diferentes estações do ano na Pensilvânia, EUA. Nós encontramos um padrão genômico de variação clinal refletindo variação sazonal. Esse padrão é mais forte para variantes em regiões exônicas do que intergênicas, consistente com a ação de seleção. A relação entre variação clinal e sazonal encontrada pode ser explicada se 6,6% dos polimorfismos estiverem sob seleção espacial e sazonal. Nossos resultados são consistentes com ahipótese adaptativa de variação clinal e, junto com outras observações, revelam que o papel da demografia na manutenção de clinas em D. melanogaster é limitado
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 29.08.2018
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      RODRIGUES, Murillo Fernando; COGNI, Rodrigo. Adaptive or neutral clines? Integrating genome-wide clinal and seasonal variation to infer natural selection in Drosophila melanogaster. 2018.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-26112018-153816/ >.
    • APA

      Rodrigues, M. F., & Cogni, R. (2018). Adaptive or neutral clines? Integrating genome-wide clinal and seasonal variation to infer natural selection in Drosophila melanogaster. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-26112018-153816/
    • NLM

      Rodrigues MF, Cogni R. Adaptive or neutral clines? Integrating genome-wide clinal and seasonal variation to infer natural selection in Drosophila melanogaster [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-26112018-153816/
    • Vancouver

      Rodrigues MF, Cogni R. Adaptive or neutral clines? Integrating genome-wide clinal and seasonal variation to infer natural selection in Drosophila melanogaster [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-26112018-153816/

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