Redes complexas em sistemas celulares e moleculares de plantas (2018)
- Authors:
- USP affiliated author: ALMEIDA FILHO, HUMBERTO ANTUNES DE - IFSC
- School: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Subjects: PLANTAS; METABOLISMO VEGETAL; REDES COMPLEXAS
- Keywords: Estômatos; Metabolic Networks; Plant; Redes metabólicas; Stomata
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Células estomáticas e reações metabólicas de plantas foram modelados por meio da teoria dos grafos neste trabalho; a distância entre estômatos vizinhos na folha foi adotada como parâmetro utilizado para a conectividade em redes onde os estômatos foram definidos como nodos. A direção da formação de produtos e substratos em reações metabólicas determinou a conectividade nas redes metabólicas, onde cada metabólito foi definido como um nodo. As redes de estômatos foram capazes de gerar uma grande quantidade de informação geométrica associada à distância entre os estômatos. Estas medidas se mostraram uma poderosa ferramenta para avaliar a plasticidade fenotípica em folhas de plantas. A adaptação de plantas a condições ambientais extremas, como altas taxas de umidade e grandes variações no tempo de exposição à luz, puderam ser quantificadas por parâmetros de redes. Parâmetros topológicos globais das redes metabólicas mostraram que elas possuem propriedades estatísticas e topológicas de redes livre escala, como nos seres vivos em geral. Entretanto, alguns parâmetros topológicos locais das redes como a medida hub-score, geram vetores de características que, se comparados entre plantas, geram informação filogenética. Além disso, nós comprovamos que é possível construir modelos que sugerem uma organização geral para o metabolismo, por meio de algorítmos de conectividade hierárquica. O algorítmo de k-cores foi usado para gerar camadas de conectividade nas redes metabólicas. Aatribuição química dos metabólitos ao longo das camadas k-core, mostra que a hierarquia de conexões está associada a especialização do metabolismo. Isto sugere que o algorítimo também gera informação sobre a evolução da maquinaria metabólica. Portanto, o modelo para conectar elementos de uma rede metabólica adotado neste trabalho, traz informações naturais sobre as plantas, o que sugere que exista parâmetros físicos das reações metabólicas representados pelo modelo
- Imprenta:
- Place of publication: São Carlos
- Date published: 2018
- Data da defesa: 30.05.2018
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ABNT
ALMEIDA FILHO, Humberto Antunes de. Redes complexas em sistemas celulares e moleculares de plantas. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17092018-102042/. Acesso em: 06 jul. 2022. -
APA
Almeida Filho, H. A. de. (2018). Redes complexas em sistemas celulares e moleculares de plantas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17092018-102042/ -
NLM
Almeida Filho HA de. Redes complexas em sistemas celulares e moleculares de plantas [Internet]. 2018 ;[citado 2022 jul. 06 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17092018-102042/ -
Vancouver
Almeida Filho HA de. Redes complexas em sistemas celulares e moleculares de plantas [Internet]. 2018 ;[citado 2022 jul. 06 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-17092018-102042/
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