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Sequenciamento de nova geração para rastreamento de mutações de resistência aos novos medicamentos utilizados no tratamento da hepatite C (2017)

  • Authors:
  • Autor USP: GASPARETO, KARINE VIEIRA - BIOTECNOLOGIA
  • Unidade: BIOTECNOLOGIA
  • Subjects: VÍRUS DA HEPATITE C; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; ENZIMAS PROTEOLÍTICAS; ATIVAÇÃO ENZIMÁTICA; DNA POLIMERASES; MUTAÇÃO GENÉTICA
  • Keywords: Antivirais; Antivirals; Biologia molecular; Genetic sequencing; Hepatitis C virus; Molecular biology; Mutação; Mutation; Sequenciamento genético; Vírus da hepatite C
  • Language: Português
  • Abstract: O presente estudo realizou o sequenciamento de nova geração do vírus da hepatite C genótipo 1, incluindo os subtipos 1a (n=51) e 1b (n=49), e identificou variantes associadas com resistência (RAV) aos antivirais de ação direta em pacientes sem tratamento prévio. No subtipo 1a, foram encontradas RAV para as regiões NS3-4A, NS5A e NS5B em 10%, 22% e 8% dos pacientes, respectivamente. RAV detectadas foram: T54S (2%), V55A (2%), Q80K (4%) e R155K (2%) na protease NS3-4A; Q30H (4%), H58P (10%) e Q30H/R+Y93C/H/N (8%) na região NS5A; e A421V (8%) na polimerase NS5B. As frequências das RAV para o subtipo 1b foram 12%, 53% e 31% para as regiões NS3-4A, NS5A e NS5B, respectivamente. Foram encontradas as RAV F43I (2%), T54S (4%), Q80H (2%), D168E (2%) e M175L (2%) na região NS3-4A; L28M (2%), R30Q (2%), L31M (2%), Q54H (27%), A92T (2%), Y93H (4%), Q54H+A92T (6%), Q54H+Y93H (6%) e A92T+Y93H (2%) na região NS5A e, L159F (2%), C316N (4%), A421V (7%), L159F+C316N (9%) e S556G (9%) na polimerase. Utilizando esta metodologia, um recombinante inter-subtipo 1a/1b foi identificado
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 17.02.2017
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      GASPARETO, Karine Vieira. Sequenciamento de nova geração para rastreamento de mutações de resistência aos novos medicamentos utilizados no tratamento da hepatite C. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-25092018-163244/. Acesso em: 23 abr. 2024.
    • APA

      Gaspareto, K. V. (2017). Sequenciamento de nova geração para rastreamento de mutações de resistência aos novos medicamentos utilizados no tratamento da hepatite C (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-25092018-163244/
    • NLM

      Gaspareto KV. Sequenciamento de nova geração para rastreamento de mutações de resistência aos novos medicamentos utilizados no tratamento da hepatite C [Internet]. 2017 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-25092018-163244/
    • Vancouver

      Gaspareto KV. Sequenciamento de nova geração para rastreamento de mutações de resistência aos novos medicamentos utilizados no tratamento da hepatite C [Internet]. 2017 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-25092018-163244/

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