Molecular pairwise relatedness in autopolyploids: a simulation study considering linkage and many loci (2018)
- Authors:
- USP affiliated author: AMADEU, RODRIGO RAMPAZO - ESALQ
- School: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: GENOMAS; MARCADOR MOLECULAR; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; PLANTAS CULTIVADAS
- Keywords: Parentesco molecular; Poliploides
- Language: Inglês
- Abstract: Culturas agrícolas como cana-de-açúcar, batata, batata doce, diferentes forrageiras e frutas são autopoliploides. Em melhoramento de plantas, o conhecimento do parentesco entre cultivares é crítico. Essa informação pode ser incorporada em estudos de GWAS (genome-wide association studies) e GS (genomic selection) permitindo uma análise genética e predição de QTLs e valores genéticos de maior poder estatístico. No entanto, faltam estudos genéticos que considerem parentesco em um cenário autopoliploide. Nossos objetivos neste trabalho são: i) investigar, através de simulações, diferentes estimadores de parentesco entre indivíduos; ii) recomendar o melhor estimador basedo em cenários específicos considerando diferentes número de loci, número de alelos, ploidia, nível de dupla-redução e endogamia. Nossas recomendações poderão orientar estratégias de programas de melhoramento genético de espécies autopoliploides para escolha de estimadores baseados em seu cenário específico
- Imprenta:
- Place of publication: Piracicaba
- Date published: 2018
- Data da defesa: 14.03.2018
-
ABNT
AMADEU, Rodrigo Rampazo; GARCIA, Antonio Augusto Franco. Molecular pairwise relatedness in autopolyploids: a simulation study considering linkage and many loci. 2018.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2018. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-25072018-181323/ >. -
APA
Amadeu, R. R., & Garcia, A. A. F. (2018). Molecular pairwise relatedness in autopolyploids: a simulation study considering linkage and many loci. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-25072018-181323/ -
NLM
Amadeu RR, Garcia AAF. Molecular pairwise relatedness in autopolyploids: a simulation study considering linkage and many loci [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-25072018-181323/ -
Vancouver
Amadeu RR, Garcia AAF. Molecular pairwise relatedness in autopolyploids: a simulation study considering linkage and many loci [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-25072018-181323/ - Metabolite profiles of sugarcane culm reveal the relationship among metabolism and axillary bud outgrowth in genetically related sugarcane commercial cultivars
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