Evolutionary studies in South American marsh rats (Rodentia: Holochilus) (2017)
- Authors:
- Autor USP: PRADO, JOYCE RODRIGUES DO - Interunidades em Ecologia Aplicada
- Unidade: Interunidades em Ecologia Aplicada
- Sigla do Departamento: LCB
- Subjects: EVOLUÇÃO ANIMAL; GENÔMICA; MORFOMETRIA; ROEDORES; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
- Language: Inglês
- Abstract: Uma abordagem interdisciplinar integrando micro e macroevolução, variação genômica, morfométrica e morfológica, sistemática, genética quantitativa e biogeografia foi empregada para investigar a história evolutiva do gênero Holochilus (Rodentia: Sigmodontinae). O gênero Holochilus apresenta espécies mal definidas, com problemas nomenclaturais e relações desconhecida. O número atual de espécies possivelmente não reflete a sua diversidade real e, até o momento, não foi realizado nenhum trabalho combinando evidências genéticas e morfométricas englobando toda a distribuição geográfica desse grupo. Este gênero pertence à tribo Oryzomyini, e juntamente com outros 14 gêneros (a diversidade genérica mais abrangente da tribo) formam o clado D. A relação filogenética interna dentro deste clado ainda é variável. Devido à sua ampla distribuição geográfica, Holochilus também representa uma peça chave no estudo da evolução dos oryzomíneos de formações abertas da América do Sul. Com base em uma amostragem abrangente, analisei padrões de variação morfométrica e genômica dentro de Holochilus, a fim de delimitar as espécies pertencentes a este gênero, bem como acessar a relação filogenética entre essas linhagens. Investiguei a variação sexual e ontogenética deste grupo, comparando populações naturais e de cativeiro, buscando entender o efeito das diferenças ambientais no padrão de variação e nas trajetórias ontogenéticas (Capítulo 1). Eu também avaliei e comparei a variação genômica entre trêsespécies de Holochilus a fim de verificar a influência dos biomas e das mudanças climáticas nas assinaturas genômicas das espécies (Capítulo 2). Em seguida eu apliquei uma abordagem baseada em modelos para delimitar as espécies (Capítulo 3). Finalmente, investigações adicionais foram realizadas para propor as relações filogenéticas entre os membros do clade D, fornecendo datas para os principais eventos de diversificação, e inferências sobre possíveis processos responsáveis pelo padrão biogeográfico atual, relacionado os mesmos com a ocupação florestal e áreas abertas (Capítulo 4). O dimorfismo sexual apresentou pequeno grau de variação entre as populações. A maior variação ontogenética é encontrada nas classes etárias mais jovens e mais velhas. Há também grandes diferenças nas trajetórias ontogenéticas entre as amostras, onde indivíduos da população cativeiro exibiram o menor grau de variação entre todas as classes etárias. A análise genética quantitativa mostrou que diferenças genômicas são observadas em todos os táxons e essa diferença está associada à geografia. Modelos de nichos ecológicos revelaram que os biomas com maiores áreas de estabilidade também apresentaram maior estruturação genômica, sugerindo que uma dimensão histórica impactou o isolamento/conectividade entre as populações. Os resultados também mostram que os biomas não só diferem geograficamente e ambientalmente (baseado em condições climáticas passadas), mas também mostram associação significativa entreo espaço ambiental e a variação genética que não está relacionada com a geografia. Adicionalmente, foi recuperado oito linhagens independentes dentro de Holochilus, e o arranjo filogenético parcialmente corrobora estudos anteriores. Finalmente, a filogenia proposta para o clado D apresentou algumas diferenças em comparação com outros estudos, e sugeriu que a maioria dos eventos cladogenéticos ocorreram durante o Pleistoceno, sendo a expansão dos ambientes abertos um importante motor de diversificação neste grupo
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2017
- Data da defesa: 05.09.2017
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ABNT
PRADO, Joyce Rodrigues. Evolutionary studies in South American marsh rats (Rodentia: Holochilus). 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-14032018-110612/. Acesso em: 28 fev. 2026. -
APA
Prado, J. R. (2017). Evolutionary studies in South American marsh rats (Rodentia: Holochilus) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-14032018-110612/ -
NLM
Prado JR. Evolutionary studies in South American marsh rats (Rodentia: Holochilus) [Internet]. 2017 ;[citado 2026 fev. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-14032018-110612/ -
Vancouver
Prado JR. Evolutionary studies in South American marsh rats (Rodentia: Holochilus) [Internet]. 2017 ;[citado 2026 fev. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/91/91131/tde-14032018-110612/ - Revisão taxonômica de Aegialomys (Weksler, Percequillo & Voss, 2006) (Cricetidae: Sigmodontinae)
- Patterns of genetic and epigenetic diversity across a range expansion in the white-footed mouse (Peromyscus Leucopus)
- A new species of South America marsh rat (Holochilus, Cricetidae) from northeastern Brazil
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- Postglacial colonization in the Great Lakes Region by the white-footed mouse (Peromyscus leucopus): conflicts between genomic and field data
- Variação Geográfica no gênero Aegialomys (Weksler, Percequillo & Voss, 2006) (Cricetidae: Sigmodontinae)
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- Recent, intricate speciation in Amazonia uncovered by a multilayered genomic analysis of tree squirrels
- Ontogenetic and Sexual Variation in cranial characters of Aegialomys xanthaeolus (Thomas, 1894) (Cricetidae: Sigmodontinae) from Ecuador and Peru
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