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Improving accuracy of genomic prediction in maize single-crosses through different kernels and reducing the marker dataset (2017)

  • Authors:
  • Autor USP: SOUSA, MASSáINE BANDEIRA E - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LGN
  • Subjects: GENÔMICA; HIBRIDAÇÃO VEGETAL; INTERAÇÃO GENÓTIPO-AMBIENTE; MILHO; MODELOS MATEMÁTICOS; SELEÇÃO GENÉTICA
  • Language: Inglês
  • Abstract: No melhoramento de plantas, a predição genômica (PG) é uma eficiente ferramenta para aumentar a eficiência seletiva de genótipos, principalmente, considerando múltiplos ambientes. Esta técnica tem como vantagem incrementar o ganho genético para características complexas e reduzir os custos. Entretanto, ainda são necessárias estratégias que aumentem a acurácia e reduzam o viés dos valores genéticos genotípicos. Nesse contexto, os objetivos foram: i) comparar duas estratégias para obtenção de subconjuntos de marcadores baseado em seus efeitos em relação ao seu impacto na acurácia da seleção genômica; ii) comparar a acurácia seletiva de quatro modelos de PG incluindo o efeito de interação genótipo × ambiente (G×A) e dois kernels (GBLUP e Gaussiano). Para isso, foram usados dados de um painel de diversidade de arroz (RICE) e dois conjuntos de dados de milho (HEL e USP). Estes foram avaliados para produtividade de grãos e altura de plantas. Em geral, houve incremento da acurácia de predição e na eficiência da seleção genômica usando subconjuntos de marcadores. Estes poderiam ser utilizados para construção de arrays e, consequentemente, reduzir os custos com genotipagem. Além disso, utilizando o kernel Gaussiano e incluindo o efeito de interação G×A há aumento na acurácia dos modelos de predição genômica
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 09.08.2017
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      SOUSA, Massáine Bandeira e; FRITSCHE NETO, Roberto. Improving accuracy of genomic prediction in maize single-crosses through different kernels and reducing the marker dataset. 2017.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2017. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07032018-163203/ >.
    • APA

      Sousa, M. B. e, & Fritsche Neto, R. (2017). Improving accuracy of genomic prediction in maize single-crosses through different kernels and reducing the marker dataset. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07032018-163203/
    • NLM

      Sousa MB e, Fritsche Neto R. Improving accuracy of genomic prediction in maize single-crosses through different kernels and reducing the marker dataset [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07032018-163203/
    • Vancouver

      Sousa MB e, Fritsche Neto R. Improving accuracy of genomic prediction in maize single-crosses through different kernels and reducing the marker dataset [Internet]. 2017 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-07032018-163203/

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