A composite docking approach for the identification and characterization of ectosteric inhibitors of cathepsin K (2017)
- Authors:
- Law, Simon - The University of British Columbia (UBC)
- Panwar, Preety - The University of British Columbia (UBC)
- Li, Jody - The University of British Columbia (UBC)
- Aguda, Adeleke H. - The University of British Columbia (UBC)
- Jamroz, Andrew - The University of British Columbia (UBC)
- Guido, Rafael Victorio Carvalho
- Brömme, Dieter - The University of British Columbia (UBC)
- Autor USP: GUIDO, RAFAEL VICTÓRIO CARVALHO - IFSC
- Unidade: IFSC
- DOI: 10.1371/journal.pone.0186869
- Subjects: ENZIMAS; COLÁGENO; INIBIDORES DE ENZIMAS
- Language: Inglês
- Imprenta:
- Publisher: Public Library of Science - PLOS
- Publisher place: San Francisco
- Date published: 2017
- Source:
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by
-
ABNT
LAW, Simon; PANWAR, Preety; LI, Jody; et al. A composite docking approach for the identification and characterization of ectosteric inhibitors of cathepsin K. PLOS ONE, San Francisco, Public Library of Science - PLOS, v. 12, n. 10, p. e0186869-1-e0186869-21, 2017. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0186869 > DOI: 10.1371/journal.pone.0186869. -
APA
Law, S., Panwar, P., Li, J., Aguda, A. H., Jamroz, A., Guido, R. V. C., & Brömme, D. (2017). A composite docking approach for the identification and characterization of ectosteric inhibitors of cathepsin K. PLOS ONE, 12( 10), e0186869-1-e0186869-21. doi:10.1371/journal.pone.0186869 -
NLM
Law S, Panwar P, Li J, Aguda AH, Jamroz A, Guido RVC, Brömme D. A composite docking approach for the identification and characterization of ectosteric inhibitors of cathepsin K [Internet]. PLOS ONE. 2017 ; 12( 10): e0186869-1-e0186869-21.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0186869 -
Vancouver
Law S, Panwar P, Li J, Aguda AH, Jamroz A, Guido RVC, Brömme D. A composite docking approach for the identification and characterization of ectosteric inhibitors of cathepsin K [Internet]. PLOS ONE. 2017 ; 12( 10): e0186869-1-e0186869-21.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0186869 - Estudo das relações quantitativas entre estrutura e atividade de uma série de inibidores azóis de plasmodium falciparum
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Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.pone.0186869 (Fonte: oaDOI API)
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Referências citadas na obra
| Autor: F Lecaille Título: Human and parasitic papain-like cysteine proteases: their role in physiology and pathology and recent developments in inhibitor design Título do periódico: Chem Rev Volume: 102 Fascículo: 12 Primeira página: 4459 Ano: 2002 DOI: 10.1021/cr0101656 |
|---|
| Autor: Y Yasuda Título: Cathepsin V, a novel and potent elastolytic activity expressed in activated macrophages Título do periódico: J Biol Chem Volume: 279 Fascículo: 35 Primeira página: 36761 Ano: 2004 DOI: 10.1074/jbc.M403986200 |
| Autor: W Kafienah Título: Human cathepsin K cleaves native type I and II collagens at the N-terminal end of the triple helix Título do periódico: Biochem J Volume: 331 Primeira página: 727 Ano: 1998 DOI: 10.1042/bj3310727 |
| Autor: P Garnero Título: The collagenolytic activity of cathepsin K is unique among mammalian proteinases Título do periódico: J Biol Chem Volume: 273 Primeira página: 32347 Ano: 1998 DOI: 10.1074/jbc.273.48.32347 |
| Autor: D Bromme Título: Thiol-dependent cathepsins: pathophysiological implications and recent advances in inhibitor design Título do periódico: Curr Pharm Des Volume: 8 Fascículo: 18 Primeira página: 1639 Ano: 2002 DOI: 10.2174/1381612023394179 |
| Autor: SP Lutgens Título: Cathepsin cysteine proteases in cardiovascular disease Título do periódico: Faseb J Volume: 21 Fascículo: 12 Primeira página: 3029 Ano: 2007 DOI: 10.1096/fj.06-7924com |
| Autor: D Bromme Título: Cystein cathepsins and the skeleton Título do periódico: Clinical Reviews in Bone and Mineral Metabolism Volume: 9 Fascículo: 2 Primeira página: 83 Ano: 2011 DOI: 10.1007/s12018-011-9101-y |
| Autor: DS Yamashita Título: Cathepsin K and the design of inhibitors of cathepsin K Título do periódico: Curr Pharm Des Volume: 6 Primeira página: 1 Ano: 2000 DOI: 10.2174/1381612003401569 |
| Autor: DS Yamashita Título: Structure and design of potent and selective cathepsin K inhibitors Título do periódico: Journal of the American Chemical Society Volume: 119 Primeira página: 11351 Ano: 1997 DOI: 10.1021/ja972204u |
| Autor: B Turk Título: Targeting proteases: successes, failures and future prospects Título do periódico: Nat Rev Drug Discov Volume: 5 Fascículo: 9 Primeira página: 785 Ano: 2006 DOI: 10.1038/nrd2092 |
| Autor: D Bromme Título: Cathepsin K inhibitors for osteoporosis and potential off-target effects Título do periódico: Expert Opin Investig Drugs Volume: 18 Fascículo: 5 Primeira página: 585 Ano: 2009 DOI: 10.1517/13543780902832661 |
| Autor: TM Runger Título: Morphea-like skin reactions in patients treated with the cathepsin K inhibitor balicatib Título do periódico: J Am Acad Dermatol Volume: 66 Fascículo: 3 Primeira página: e89 Ano: 2012 DOI: 10.1016/j.jaad.2010.11.033 |
| Autor: D Bromme Título: Cathepsin K osteoporosis trials, pycnodysostosis and mouse deficiency models: Commonalities and differences Título do periódico: Expert Opin Drug Discov Volume: 11 Fascículo: 5 Primeira página: 457 Ano: 2016 DOI: 10.1517/17460441.2016.1160884 |
| Autor: A Mullard Título: Merck &Co. drops osteoporosis drug odanacatib Título do periódico: Nat Rev Drug Discov Volume: 15 Fascículo: 10 Primeira página: 669 Ano: 2016 DOI: 10.1038/nrd.2016.207 |
| Autor: X Du Título: Elastin degradation by cathepsin V requires two exosites Título do periódico: J Biol Chem Volume: 288 Fascículo: 48 Primeira página: 34871 Ano: 2013 DOI: 10.1074/jbc.M113.510008 |
| Autor: V Sharma Título: Structural requirements for the collagenase and elastase activity of cathepsin K and its selective inhibition by an exosite inhibitor Título do periódico: Biochem J Volume: 465 Fascículo: 1 Primeira página: 163 Ano: 2015 DOI: 10.1042/BJ20140809 |
| Autor: P Panwar Título: A novel approach to inhibit bone resorption: exosite inhibitors against cathepsin K Título do periódico: Br J Pharmacol Volume: 173 Fascículo: 2 Primeira página: 396 Ano: 2016 DOI: 10.1111/bph.13383 |
| Autor: P Panwar Título: An Ectosteric Inhibitor of Cathepsin K Inhibits Bone Resorption in Ovariectomized Mice Título do periódico: J Bone Miner Res Ano: 2017 |
| Autor: GM Sastry Título: Protein and ligand preparation: parameters, protocols, and influence on virtual screening enrichments Título do periódico: J Comput Aided Mol Des Volume: 27 Fascículo: 3 Primeira página: 221 Ano: 2013 DOI: 10.1007/s10822-013-9644-8 |
| Autor: R Spitzer Título: Surflex-Dock: Docking benchmarks and real-world application Título do periódico: J Comput Aided Mol Des Volume: 26 Fascículo: 6 Primeira página: 687 Ano: 2012 DOI: 10.1007/s10822-011-9533-y |
| Autor: RA Friesner Título: Glide: a new approach for rapid, accurate docking and scoring. 1. Method and assessment of docking accuracy Título do periódico: J Med Chem Volume: 47 Fascículo: 7 Primeira página: 1739 Ano: 2004 DOI: 10.1021/jm0306430 |
| Autor: G Jones Título: Development and validation of a genetic algorithm for flexible docking Título do periódico: J Mol Biol Volume: 267 Fascículo: 3 Primeira página: 727 Ano: 1997 DOI: 10.1006/jmbi.1996.0897 |
| Autor: CJ Linnevers Título: Expression of human cathepsin K in <italic>Pichia pastoris</italic> and preliminary crystallographic studies of an inhibitor complex Título do periódico: Protein Science Volume: 6 Primeira página: 919 Ano: 1997 DOI: 10.1002/pro.5560060421 |
| Autor: P Panwar Título: Aging-associated modifications of collagen affect its degradation by matrix metalloproteinases Título do periódico: Matrix Biol Ano: 2017 |
| Autor: CA Schneider Título: NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis Título do periódico: Nat Methods Volume: 9 Fascículo: 7 Primeira página: 671 Ano: 2012 DOI: 10.1038/nmeth.2089 |
| Autor: D Brömme Título: Human cathepsin O2, a matrix protein-degrading cysteine protease expressed in osteoclasts. Functional expression of human cathepsin O2 in Spodoptera frugiperda and characterization of the enzyme Título do periódico: J Biol Chem Volume: 271 Fascículo: 4 Primeira página: 2126 Ano: 1996 DOI: 10.1074/jbc.271.4.2126 |
| Autor: K Soe Título: Glucocorticoids maintain human osteoclasts in the active mode of their resorption cycle Título do periódico: J Bone Miner Res Volume: 25 Fascículo: 10 Primeira página: 2184 Ano: 2010 DOI: 10.1002/jbmr.113 |
| Autor: AH Aguda Título: Structural basis of collagen fiber degradation by cathepsin K Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A Volume: 111 Fascículo: 49 Primeira página: 17474 Ano: 2014 DOI: 10.1073/pnas.1414126111 |
| Autor: TA Halgren Título: Identifying and characterizing binding sites and assessing druggability Título do periódico: J Chem Inf Model Volume: 49 Fascículo: 2 Primeira página: 377 Ano: 2009 DOI: 10.1021/ci800324m |
| Autor: CA Lipinski Título: Lead- and drug-like compounds: the rule-of-five revolution Título do periódico: Drug Discov Today Technol Volume: 1 Fascículo: 4 Primeira página: 337 Ano: 2004 DOI: 10.1016/j.ddtec.2004.11.007 |
| Autor: YP Pan Título: Consideration of molecular weight during compound selection in virtual database screening Título do periódico: Abstr Pap Am Chem S Volume: 224 Primeira página: U495 Ano: 2002 |
| Autor: AK Ghose Título: A knowledge-based approach in designing combinatorial or medicinal chemistry libraries for drug discovery. 1. A qualitative and quantitative characterization of known drug databases Título do periódico: J Comb Chem Volume: 1 Fascículo: 1 Primeira página: 55 Ano: 1999 DOI: 10.1021/cc9800071 |
| Autor: DR Houston Título: Structure- and ligand-based virtual screening identifies new scaffolds for inhibitors of the oncoprotein MDM2 Título do periódico: PLoS One Volume: 10 Fascículo: 4 Primeira página: e0121424 Ano: 2015 DOI: 10.1371/journal.pone.0121424 |
| Autor: KR Valasani Título: Structure based design, synthesis, pharmacophore modeling, virtual screening, and molecular docking studies for identification of novel cyclophilin D inhibitors Título do periódico: J Chem Inf Model Volume: 54 Fascículo: 3 Primeira página: 902 Ano: 2014 DOI: 10.1021/ci5000196 |
| Autor: H Alonso Título: Combining docking and molecular dynamic simulations in drug design Título do periódico: Med Res Rev Volume: 26 Fascículo: 5 Primeira página: 531 Ano: 2006 DOI: 10.1002/med.20067 |
| Autor: G Rastelli Título: Discovery of new inhibitors of aldose reductase from molecular docking and database screening Título do periódico: Bioorg Med Chem Volume: 10 Fascículo: 5 Primeira página: 1437 Ano: 2002 DOI: 10.1016/S0968-0896(01)00410-2 |
| Autor: P Corsino Título: A Novel Class of Cyclin-dependent Kinase Inhibitors Identified by Molecular Docking Act through a Unique Mechanism Título do periódico: Journal of Biological Chemistry Volume: 284 Fascículo: 43 Primeira página: 29945 Ano: 2009 DOI: 10.1074/jbc.M109.055251 |
| Autor: K Sullivan Título: Identification of a Small Molecule Inhibitor of RAD52 by Structure-Based Selection Título do periódico: PLoS One Volume: 11 Fascículo: 1 Primeira página: e0147230 Ano: 2016 DOI: 10.1371/journal.pone.0147230 |
| Autor: SZ Grinter Título: Challenges, applications, and recent advances of protein-ligand docking in structure-based drug design Título do periódico: Molecules Volume: 19 Fascículo: 7 Primeira página: 10150 Ano: 2014 DOI: 10.3390/molecules190710150 |
| Autor: P Ferrara Título: Assessing scoring functions for protein-ligand interactions Título do periódico: J Med Chem Volume: 47 Fascículo: 12 Primeira página: 3032 Ano: 2004 DOI: 10.1021/jm030489h |
| Autor: G Carta Título: Unbiasing scoring functions: a new normalization and rescoring strategy Título do periódico: J Chem Inf Model Volume: 47 Fascículo: 4 Primeira página: 1564 Ano: 2007 DOI: 10.1021/ci600471m |
| Autor: F Ntie-Kang Título: An in silico evaluation of the ADMET profile of the StreptomeDB database Título do periódico: Springerplus Volume: 2 Primeira página: 353 Ano: 2013 DOI: 10.1186/2193-1801-2-353 |
| Autor: BY Feng Título: A high-throughput screen for aggregation-based inhibition in a large compound library Título do periódico: J Med Chem Volume: 50 Fascículo: 10 Primeira página: 2385 Ano: 2007 DOI: 10.1021/jm061317y |
| Autor: BY Feng Título: A detergent-based assay for the detection of promiscuous inhibitors Título do periódico: Nat Protoc Volume: 1 Fascículo: 2 Primeira página: 550 Ano: 2006 DOI: 10.1038/nprot.2006.77 |
| Autor: MT Drake Título: Cathepsin K Inhibitors for Osteoporosis: Biology, Potential Clinical Utility, and Lessons Learned Título do periódico: Endocr Rev Ano: 2017 |
| NCI Yeast Anticancer Drug Screen. Data for the mlh1 rad18 strain [Internet]. National Center for Biotechnology Information. 2004. <ext-link xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" ext-link-type="uri" xlink:href="https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/bioassay/175" xlink:type="simple">https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/bioassay/175</ext-link>. |
| Autor: MS Dunstan Título: Novel inhibitors of NRH:quinone oxidoreductase 2 (NQO2): crystal structures, biochemical activity, and intracellular effects of imidazoacridin-6-ones Título do periódico: J Med Chem Volume: 54 Fascículo: 19 Primeira página: 6597 Ano: 2011 DOI: 10.1021/jm200416e |
