Molecular variability among Brazilian strains of the sugarcane smut pathogen and the genetic basis of host specialization in smut fungi (2017)
- Authors:
- Autor USP: BENEVENUTO, JULIANA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; CARVÃO (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; GENÔMICA; PLANTAS HOSPEDEIRAS; VARIAÇÃO GENÉTICA
- Language: Inglês
- Abstract: Fitopatógenos apresentam a habilidade de rapidamente suplantar os mecanismos de defesas da planta e adaptar-se a um novo hospedeiro. A (re)emergência de patógenos é uma das maiores preocupações na agricultura e na conservação de populações naturais. A rápida adaptação ao hospedeiro e a novos ambientes depende da variabilidade genética nas populações de patógenos. Apesar da importância da cana-de-açúcar para o agronegócio brasileiro e da persistência do patógeno Sporisorium scitamineum, o agente causal do carvão da cana-de-açúcar, na maioria das áreas canavieiras, estudos de variabilidade genética ainda não foram realizados para isolados brasileiros. Nos capítulos 1 e 2, estudos de variabilidade molecular foram realizados para isolados brasileiros e argentinos de S. scitamineum, usando marcadores moleculares (AFLP e telRFLP) e dados de sequenciamento (ITS e um gene candidato a efetor). Nenhum polimorfismo foi encontrado usando sequências ITS. Contrariamente, o marcador telRFLP gerou quase um fingerprint para cada linhagem. Dois grupos geneticamente distintos foram formados pela análise conjunta dos marcadores telRFLP e AFLP. Os dois grupos também foram formados pelos haplótipos obtidos pelo sequenciamento de um candidato a efetor. A presença de polimorfismos causando mutações não-sinônimas em um candidato a efetor pode acarretar em performances distintas em diferentes genótipos de cana-de-açúcar. S. scitamineum pertence à classe Ustilaginomycetes, a qual também abrange váriosoutros agentes causais de doenças do carvão. Apesar de filogeneticamente próximos e com estilo de vida similar, espécies de carvão apresentam uma faixa distinta e estreita de hospedeiros. Portanto, outro objetivo desta tese foi identificar a base genética da especialização ao hospedeiro por fungos causadores de carvão usando análises de genômica comparativa. No capítulo 3, os loci envolvidos na determinação do tipo de reação sexual (mating-type) foram caracterizados no genoma de S. scitamineum e comparados com sequências de outras espécies de carvão. Tranposons foram identificados como provável mecanismo de rearranjo cromossômico entre os loci de mating-type. Polimorfismos trans-específicos nos genes codificadores de feromônios e receptores sugerem o potencial de hibridização entre espécies de carvão. No capítulo 4, análises de genômica comparativa abrangendo nove espécies de carvão infectando hospedeiros distintos foram realizadas. A base genética da especialização ao hospedeiro em fungos causadores de carvão é complexa e parece envolver processos evolutivos de ganho/perda de genes e seleção positiva. Efetores espécie-específicos e sob seleção positiva são destacados como bons candidatos para serem caracterizados quanto ao papel que estabelecem na adaptação ao hospedeiro
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2017
- Data da defesa: 19.05.2017
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ABNT
BENEVENUTO, Juliana. Molecular variability among Brazilian strains of the sugarcane smut pathogen and the genetic basis of host specialization in smut fungi. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-29082017-085644/. Acesso em: 31 dez. 2025. -
APA
Benevenuto, J. (2017). Molecular variability among Brazilian strains of the sugarcane smut pathogen and the genetic basis of host specialization in smut fungi (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-29082017-085644/ -
NLM
Benevenuto J. Molecular variability among Brazilian strains of the sugarcane smut pathogen and the genetic basis of host specialization in smut fungi [Internet]. 2017 ;[citado 2025 dez. 31 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-29082017-085644/ -
Vancouver
Benevenuto J. Molecular variability among Brazilian strains of the sugarcane smut pathogen and the genetic basis of host specialization in smut fungi [Internet]. 2017 ;[citado 2025 dez. 31 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-29082017-085644/
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