Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras (2017)
- Authors:
- Autor USP: BESERRA, LAILA ANDREIA RODRIGUES - FMVZ
- Unidade: FMVZ
- Sigla do Departamento: VPS
- Subjects: AVES; ROTAVIRUS; GENÓTIPOS; RECOMBINAÇÃO GENÉTICA
- Keywords: Avian; Codons; Códons; Genotypes; Recombinação; Recombination; Rotavírus
- Language: Português
- Abstract: Os rotavírus, membros da família Reoviridae, são uma importante causa de diarreia em mamíferos e aves. São partículas icosaédricas não envelopadas e seu genoma é formado por 11 segmentos de RNA fita dupla que codificam seis proteínas estruturais e seis proteínas não estruturais. O objetivo deste estudo foi caracterizar os genes codificadores das proteínas não estruturais (NSP1-5) e estruturais (VP1-4, VP6-7) dos rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais (corte, postura, matrizeiros e avozeiros) localizadas em 12 estados brasileiros, seguido de análises de recombinação e pressão de seleção das amostras definidas. Um total de 226 amostras fecais foram triadas através de reações de RT-PCR tendo como alvo a amplificação da VP6 e NSP5. A frequência de ocorrência, baseada em cada uma destas provas, variou de 9,7% a 18,14%, respectivamente. Em seguida, 10 das amostras positivas foram processadas com primers específicos visando a amplificação dos demais genes, seguido do sequenciamento nucleotídico e filogenia baseada no método de maximum likelihood, tendo como modelos de substituição GTR (NSP1-3, VP1-3, VP4, VP6, VP7) e HKY (NSP4, NSP5) e 1.000 repetições de bootstrap. Foram definidas sequências parciais para os genes codificadores da VP1-4, VP6-7 e NSP1-4 e sequências completas para NSP5. As respectivas árvores demonstraram que as dez amostras definidas se agruparam em clados aviários previamente descritos. Duas constelações genotípicas foram caracterizadas:G19-P[31]-I11-R6-C6-M7-A16-N6-T8-E10-H8 e G19-P[31]-I4-R4-C4-M4-A16-N4-T4-E4-H4. Estes genotipos são tipicamente encontrados em aves, mas quando analisados em conjunto, esta é a primeira descrição destas constelações. Eventos de recombinação foram observados nos genes NSP2, VP1, VP3 e VP7. Pelo menos um códon com pressão de seleção positiva foi encontrado nos genes codificadores das proteínas NSP1, VP2 e VP3. Este estudo propicia um melhor entendimento acerca da epidemiologia e diversidade viral circulante nas criações aviárias brasileiras, servindo de base para o estabelecimento de medidas profiláticas mais eficazes
- Imprenta:
- Data da defesa: 04.05.2017
-
ABNT
BESERRA, Laila Andreia Rodrigues. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27072017-154258/. Acesso em: 27 fev. 2026. -
APA
Beserra, L. A. R. (2017). Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27072017-154258/ -
NLM
Beserra LAR. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras [Internet]. 2017 ;[citado 2026 fev. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27072017-154258/ -
Vancouver
Beserra LAR. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em aves de criações comerciais brasileiras [Internet]. 2017 ;[citado 2026 fev. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27072017-154258/
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
