SNP discovery, high-density genetic map construction, and identification of genes associated with climate adaptation, and lack of intermuscular bone in tambaqui Colossoma macropomum (2017)
- Authors:
- Autor USP: NUNES, JOSé DE RIBAMAR DA SILVA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- Subjects: ADAPTAÇÃO ANIMAL; GENES; MAPEAMENTO GENÉTICO; MARCADOR MOLECULAR; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; TAMBAQUI
- Keywords: Espinha Intermuscular
- Language: Inglês
- Abstract: O tambaqui (Colossoma macropomum) é a maior espécie nativa de Characiforme da América do Sul e é encontrado nas bacias do rio Amazonas e Orinoco. O cultivo do tambaqui está crescendo rapidamente no Brasil, sua produção atingiu 139.209 toneladas em 2014, o que corresponde a 57,7% de aumento em relação a 2013. No entanto, poucos estudos genéticos realizados com o tambaqui estão disponíveis atualmente. Estudos genéticos em tambaqui, tanto em populações cultivadas quanto em populações selvagens, necessitam de uma abordagem holística para uma ação racional frente aos desafios ecológicos e mercadológicos na aquicultura. Abordagens baseadas em estudos genéticos têm fornecido ferramentas importantes para se entender a dinâmica populacional, adaptação local e função gênica visando melhorar as estratégias de seleção a serem aplicadas em programas de melhoramento genético. O sequenciamento de nova geração (NGS) permitiu um grande avanço nas abordagens genômicas e transcriptômicas, especialmente relacionadas a espécies não-modelo. A genotipagem por sequenciamento (GBS) é uma dessas abordagens que utilizam enzimas de restrição (REs) para reduzir a complexidade do genoma. Esta tese apresenta a aplicação desta abordagem objetivando proporcionar avanços significativos nos estudos genéticos de base para tambaqui. A técnica de GBS forneceu um painel de SNPs de alta densidade que nos permitiu desenvolver o primeiro mapa de ligação e estudos de associação com variáveis ambientais, adaptaçãolocal e ausência de ossos intermusculares no tambaqui. Este trabalho pode nos dar muitas referências teóricas a serem aplicadas em programas de melhoramento genético do tambaqui, permitindo uma melhor compreensão dos processos genéticos relacionados a traços de interesse na aquicultura
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2017
- Data da defesa: 08.03.2017
-
ABNT
NUNES, José de Ribamar da Silva. SNP discovery, high-density genetic map construction, and identification of genes associated with climate adaptation, and lack of intermuscular bone in tambaqui Colossoma macropomum. 2017. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03082017-094558/. Acesso em: 29 dez. 2025. -
APA
Nunes, J. de R. da S. (2017). SNP discovery, high-density genetic map construction, and identification of genes associated with climate adaptation, and lack of intermuscular bone in tambaqui Colossoma macropomum (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03082017-094558/ -
NLM
Nunes J de R da S. SNP discovery, high-density genetic map construction, and identification of genes associated with climate adaptation, and lack of intermuscular bone in tambaqui Colossoma macropomum [Internet]. 2017 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03082017-094558/ -
Vancouver
Nunes J de R da S. SNP discovery, high-density genetic map construction, and identification of genes associated with climate adaptation, and lack of intermuscular bone in tambaqui Colossoma macropomum [Internet]. 2017 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-03082017-094558/
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