Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046 (2017)
- Authors:
- Autor USP: SARMIENTO, JUAN CAMILO RONCALLO - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: PSEUDOMONAS; EXPRESSÃO GÊNICA; POLIMEROS (MATERIAIS); CARBONO; DNA RECOMBINANTE
- Keywords: Pseudomonas sp.; Pseudomonas sp.; Análise de balanço de fluxos; Catabolismo de xilose; Engenharia metabólica; Flux balance analysis; LFM046; LFM046; Metabolic engineering; Via de Weimberg; Weinberg pathway; Xylose catabolism
- Language: Português
- Abstract: Polihidroxialcanoatos (PHA) são polímeros biodegradáveis, biocompatíveis e podem ser produzidos a partir de matérias primas renováveis. Pseudomonas sp. é capaz de produzir PHA com composição monomérica variada e com teor controlável, o que confere grande variedade de aplicações. Flux Balance Analysis (FBA) foi utilizado no ambiente Matlab pelo uso do software COBRA. Para a análise foi necessário construir um core de Pseudomonas pela modificação dum core de E. coli, e assim fosse possível obter um modelo mais aproximado. Como resultado foi gerada uma rede metabólica viável contendo os genes da via de Weimberg de C. crescentus no core construído. Paralelamente, a Pseudomonas sp. LFM046 foi repicada sucessivas vezes em meio mineral (MM). Testes simples foram feitos para verificar o perfil das colônias isoladas, além de amplificar e sequenciar o gene 16S rDNA. O resultado do BLAST foi uma identidade de 99% com o gene da Pseudomonas sp. IPT 046, confirmando que a bactéria pertence a género Pseudomonas e tem a capacidade de consumir xilose
- Imprenta:
- Data da defesa: 27.01.2017
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ABNT
SARMIENTO, Juan Camilo Roncallo. Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046. 2017. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052017-163350/. Acesso em: 05 nov. 2024. -
APA
Sarmiento, J. C. R. (2017). Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052017-163350/ -
NLM
Sarmiento JCR. Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046 [Internet]. 2017 ;[citado 2024 nov. 05 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052017-163350/ -
Vancouver
Sarmiento JCR. Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046 [Internet]. 2017 ;[citado 2024 nov. 05 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052017-163350/
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