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Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos (2016)

  • Authors:
  • Autor USP: SILVA, FERNANDA DORNELAS FLORENTINO - FMVZ
  • Unidade: FMVZ
  • Sigla do Departamento: VPS
  • Subjects: ROTAVÍRUS ANIMAL; GENÉTICA; DIVERSIDADE GENÉTICA; SUÍNOS
  • Keywords: Complete genome sequencing; Constelações; Constellation; Group A rotaviruses; Grupo A de rotavírus; Sequenciamento genômico completo; Swine
  • Language: Português
  • Abstract: Os rotavírus do grupo A (RVA) são importantes causadores de diarreias virais em crianças e animais jovens de diferentes espécies, com impactos na saúde pública e animal. Visando contribuir para o entendimento e prevenção das rotaviroses assim como suas possíveis relações zoonóticas, caracterizou-se os 11 segmentos de dsRNA de rotavírus codificadores das proteínas estruturais e não estruturais presentes em amostras fecais positivas de suínos coletadas nos anos de 2012-2013, em 2 estados brasileiros. Mediante o emprego de RT-PCR, sequenciamento nucleotídico e análises filogenéticas, todos os segmentos genéticos oriundos de 12 amostras de RVA detectados em suínos foram analisados e comparados com os de outras amostras descritas previamente. As sequências obtidas para os genes codificadores das proteínas NSP2, NSP3 e VP6 contemplaram a open reading frame (ORF) completa do gene, enquanto que a ORF parcial foi determinada para os genes codificadores das proteínas VP1, VP2, VP3, VP4, VP7, NSP1, NSP4, NSP5 e NSP6. Os genotipos de rotavírus suíno provenientes das regiões amostradas concordam com os mais frequentemente descritos nesta espécie animal, apresentando, assim, uma matriz genética suína com a maioria dos segmentos pertencentes à constelação genotípica 1, com exceção dos genes codificadores das proteínas VP6 e NSP1, os quais foram os genotipos I5 e A8, respectivamente. Apesar de predominar o genotipo 1 (Wa-like) nas sequências deste estudo, a análise genômica sugere aexistência de uma variação intragenotípica no genoma do rotavírus do grupo A atualmente circulante nas populações suína amostradas dos estados de São Paulo e Mato Grosso. Adicionalmente, buscou-se identificar os aminoácidos relacionados com a adaptação dos rotavírus no hospedeiro e assinaturas genéticas que distinguissem RVA suíno e humano. Para isso, as sequências obtidas neste estudo foram comparadas com outras cepas de RVA detectadas nestas duas espécies e pertencentes ao genotipo 1 (Wa-like) disponíveis no Genbank. Como resultados foram encontrados mais de 75 sítios de mudanças deaminoácidos que diferenciam RVA suíno e humano além de sítios de substituiçãopresentes em algumas proteínas virais que frequentemente covariaram entre elas. Estes resultados proporcionam um maior entendimento da diversidade viral circulante em unidades de produção suína e uma melhor compreensão dos animaiscomo reservatórios genéticos de cepas de rotavírus emergentes em humanos
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 15.03.2016
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      SILVA, Fernanda Dornelas Florentino; GREGORI, Fabio. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos. 2016.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2016. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-30052016-120904/ >.
    • APA

      Silva, F. D. F., & Gregori, F. (2016). Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-30052016-120904/
    • NLM

      Silva FDF, Gregori F. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos [Internet]. 2016 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-30052016-120904/
    • Vancouver

      Silva FDF, Gregori F. Análise multigênica de rotavírus do grupo A em suínos [Internet]. 2016 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-30052016-120904/

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