Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico (2015)
- Authors:
- Autor USP: TORRES, MARIA ALEJANDRA FERREIRA - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: STREPTOMYCES; METABOLISMO SECUNDÁRIO; GENOMA
- Keywords: Cluster biosintético; Streptomyces; Streptomyces; Anotação de genoma; Biosynthetic Cluster; Cosmomicina D; Cosmomycin D; Genome annotation; Genome mining; Genome mining; Overexpression of regulator genes; Super-expressão de genes reguladores
- Language: Português
- Abstract: Os compostos de origem microbiana tem readquirido interesse pela biodisponibilidade, especificidade de alvo e diversidade química, mas as vias biosintéticas permanecem crípticas em condições de cultura. Uma estratégia para expressa-las é a super-expressão de genes ativadores. O laboratório de Bio-Produtos no ICB na USP tem trabalhado com Streptomyces olindensis produtor da Cosmomicina D uma molécula com atividade antitumoral de interesse devido ao padrão de glicosilação. O genoma de S. olindensis foi sequenciado e submetido ao NCBI (JJOH00000000) e utilizando o software antiSMASH foram identificados 33 clusters envolvidos na produção de metabolitos secundários. Encontraram-se clusters gênicos para a produção de metabolitos como Melanina, Geosmina, entre outros. Além, foi realizada uma analise de genômica comparativa para caracterizar e anotar as 22 vias biossintéticas desconhecidas em S. olindensis. Finalmente, escolheram-se a via do aminociclitol e um Policetídeo Tipo I para a super-expressão de genes reguladores levando a detecção do composto sob condições de cultura
- Imprenta:
- Data da defesa: 08.12.2015
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ABNT
TORRES, Maria Alejandra Ferreira. Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico. 2015. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2015. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052016-090949/. Acesso em: 24 jan. 2026. -
APA
Torres, M. A. F. (2015). Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052016-090949/ -
NLM
Torres MAF. Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico [Internet]. 2015 ;[citado 2026 jan. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052016-090949/ -
Vancouver
Torres MAF. Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico [Internet]. 2015 ;[citado 2026 jan. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052016-090949/
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