Desenvolvimento de uma plataforma molecular para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares (2014)
- Authors:
- Autor USP: MACEDO, MAYRA DORIGAN DE - FCFRP
- Unidade: FCFRP
- Sigla do Departamento: 604
- Subjects: MYCOPLASMA; REAÇÃO EM CADEIA POR POLIMERASE; CULTURA DE CÉLULAS
- Keywords: Cell culture; Cultura celular; Mycoplasma; Mycoplasma spp; PCR em tempo real; Real time PCR
- Language: Português
- Abstract: O cultivo de células humanas para fins experimentais e terapêuticos se firmou como um dos pilares da biologia celular e tem se tornado uma prática laboratorial cada vez mais disseminada. Associada a esse processo está a contaminação por microrganismos, dentre os quais se destacam as bactérias do gênero Mycoplasma spp., os quais são os contaminantes detectados com maior frequência in vitro. Um dos pontos críticos no processo de garantia da qualidade, pureza e segurança para uso destas células é a adoção de uma metodologia analítica, para detecção de Mycoplasma spp., que seja simples e de rápida execução, com sensibilidade e especificidade adequada e economicamente viável. O objetivo desse trabalho foi desenvolver uma plataforma molecular (PCR em tempo real) para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares. Para tanto, foram testados diversos conjuntos de primers (gene 16S rDNA) dentre os quais um foi selecionado para a plataforma molecular. Foram utilizadas amostras de DNA obtidas a partir do sobrenadante de cultura. A PCR em tempo real in house foi padronizada utilizando o intercalante fluorescente de DNA dupla fita BRYT Green® e produziu um fragmento de 270 pares de bases. A temperatura de melting para as amostras positivas foi definida no intervalo de 81 a 84°C. A plataforma molecular foi validada por meio dos parâmetros sensibilidade analítica e diagnóstica, especificidade analítica, potencial de arraste, precisão e robustez. O limite de detecção do teste (LOD) foide 5 cópias/5 ?L. Para a especificidade, foi observada reação cruzada com bactérias de relação filogenética próxima e com DNA de célula humana. A sensibilidade diagnóstica foi de 100%. Não foi houve contaminação por arraste. O coeficiente de variação encontrado no parâmetro precisão foi de 0,64% e 1,80% para a avaliação intra-ensaio e inter-ensaio, respectivamente. O coeficiente de variação da análise robustez foi de 5,42%. Ao comparar a plataforma molecular com o teste comercial, observou-se que 29,85% (n=40) das amostras apresentaram resultados falso-negativos pelo teste comercial. Determinou-se ainda que a PCR em tempo real in house foi mais sensível do que o teste comercial. A análise por microscopia eletrônica de varredura demonstrou a presença de estruturas sugestivas de espécies de Mycoplasma spp. na superfície das células. A análise filogenética permitiu a classificação das espécies encontradas. Os resultados obtidos neste trabalho permitiram propor o algoritmo para aplicação de um método de detecção simples e rápido para Mycoplasma spp.; e fazer deste uma ferramenta para o controle de qualidade das células cultivadas, garantindo a eficiência destas células para uso em pesquisa e maior segurança para uso em terapia celular
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2014
- Data da defesa: 24.10.2014
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ABNT
MACEDO, Mayra Dorigan de. Desenvolvimento de uma plataforma molecular para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares. 2014. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60135/tde-17042015-144258/. Acesso em: 20 jul. 2024. -
APA
Macedo, M. D. de. (2014). Desenvolvimento de uma plataforma molecular para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60135/tde-17042015-144258/ -
NLM
Macedo MD de. Desenvolvimento de uma plataforma molecular para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares [Internet]. 2014 ;[citado 2024 jul. 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60135/tde-17042015-144258/ -
Vancouver
Macedo MD de. Desenvolvimento de uma plataforma molecular para detecção de Mycoplasma spp. em culturas celulares [Internet]. 2014 ;[citado 2024 jul. 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60135/tde-17042015-144258/
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