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Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais (2014)

  • Authors:
  • Autor USP: FREIRE, CAIO CÉSAR DE MELO - BIOINFORMÁTICA
  • Unidade: BIOINFORMÁTICA
  • Assunto: BIOINFORMÁTICA
  • Agências de fomento:
  • Language: Português
  • Abstract: No presente trabalho, investigamos a filodinâmica de três modelos virais diferentes, utilizando técnicas baseadas em verossimilhança e inferência bayesiana. Dois desses são flavivírus com genoma de RNA fita simples e senso positivo. O terceiro é um bunyavírus com genoma tri-segmentado de RNA fita simples com senso negativo. Estes diferentes modelos permitiram estudar diferentes mecanismos promotores de diversidade viral, reagrupamento de segmentos genômicos (shift) e mutação (drift), que atuam em diferentes granularidades. Descrevemos pela primeira vez o espalhamento geográfico das linhagens de vírus Zika (ZIKV) em um nível continental, assim como ocorrência de recombinação e associação entre padrões de glicosilação e vetores. Para o flavivírus da encefalite transmitida por carrapatos (TBEV), investigamos seu espalhamento e encontramos evidências que corroboram a hipótese de circulação viral restrita a focos na Europa central. As análises sobre o vírus da Febre da Grande Fenda Africana (RVFV) apontaram a ocorrência de reagrupamento de segmentos genômicos e também ajudaram a elucidar sua dispersão do leste do continente africano para o oeste, encontrando-se diversas introduções no Senegal e Mauritânia. Aparentemente, este vírus teve a entrada facilitada nesses países por uma região que funciona como um centro de dispersão (hub) por ser encontro de rotas migratórias de animais. Ademais, investigamos a ocorrência de rearranjos de segmentos genômicos de RVFV e também estudamos as diferenças nas dinâmicas evolutivas de cada segmento.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 05.12.2014
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      FREIRE, Caio César de Melo; ZANOTTO, Paolo Marinho de Andrade. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais. 2014.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014 >.
    • APA

      Freire, C. C. de M., & Zanotto, P. M. de A. (2014). Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014
    • NLM

      Freire CC de M, Zanotto PM de A. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014
    • Vancouver

      Freire CC de M, Zanotto PM de A. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014

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