Tese

Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais (2014)

• Authors:
  • Freire, Caio César de Melo
  • Zanotto, Paolo Marinho de Andrade (Orientador)
• Autor USP: FREIRE, CAIO CÉSAR DE MELO - Interunidades em Bioinformática
• Unidade: Interunidades em Bioinformática
• Assunto: BIOINFORMÁTICA
• Agências de fomento:
  • Financiado pela CAPES
  • Financiado pela FAPESP
• Language: Português
• Abstract: No presente trabalho, investigamos a filodinâmica de três modelos virais diferentes, utilizando técnicas baseadas em verossimilhança e inferência bayesiana. Dois desses são flavivírus com genoma de RNA fita simples e senso positivo. O terceiro é um bunyavírus com genoma tri-segmentado de RNA fita simples com senso negativo. Estes diferentes modelos permitiram estudar diferentes mecanismos promotores de diversidade viral, reagrupamento de segmentos genômicos (shift) e mutação (drift), que atuam em diferentes granularidades. Descrevemos pela primeira vez o espalhamento geográfico das linhagens de vírus Zika (ZIKV) em um nível continental, assim como ocorrência de recombinação e associação entre padrões de glicosilação e vetores. Para o flavivírus da encefalite transmitida por carrapatos (TBEV), investigamos seu espalhamento e encontramos evidências que corroboram a hipótese de circulação viral restrita a focos na Europa central. As análises sobre o vírus da Febre da Grande Fenda Africana (RVFV) apontaram a ocorrência de reagrupamento de segmentos genômicos e também ajudaram a elucidar sua dispersão do leste do continente africano para o oeste, encontrando-se diversas introduções no Senegal e Mauritânia. Aparentemente, este vírus teve a entrada facilitada nesses países por uma região que funciona como um centro de dispersão (hub) por ser encontro de rotas migratórias de animais. Ademais, investigamos a ocorrência de rearranjos de segmentos genômicos de RVFV e também estudamos as diferenças nas dinâmicas evolutivas de cada segmento.
• Imprenta:
  • Publisher place: São Paulo
  • Date published: 2014
• Data da defesa: 05.12.2014


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How to cite

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• ABNT

  FREIRE, Caio César de Melo. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais. 2014. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014. Acesso em: 28 fev. 2026.

• APA

  Freire, C. C. de M. (2014). Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014

• NLM

  Freire CC de M. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais [Internet]. 2014 ;[citado 2026 fev. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014

• Vancouver

  Freire CC de M. Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais [Internet]. 2014 ;[citado 2026 fev. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-21012015-165014

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