Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar (2014)
- Authors:
- Autor USP: CRUZ, GUILHERME MARCELLO QUEIROGA - Interunidades em Biotecnologia
- Unidade: Interunidades em Biotecnologia
- Subjects: CANA-DE-AÇUCAR; GENOMAS; PLANTAS (GENÉTICA); SEQUÊNCIA DO DNA
- Keywords: Attachment site; Cana-de-açúcar; CpG Island; Evolutionary lineage; Genoma; Genome; Ilha CpG; Linhagem evolutiva; Long Terminal Repeat; LTR; Plantas; Plants; Retrotransposon; Retrotransposon; Sítio Att; Sugarcane
- Language: Português
- Abstract: Esta tese é estruturada em dois capítulos. O primeiro capítulo explora os retrotransposons com LTR (LTR-RT) em cana-de-açúcar e grande parte de seus resultados foram publicados no artigo ''Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns''. Nossos resultados mostraram que as diferentes famílias de LTR-RT em cana-de-açúcar possuem estruturas e regulação distintas. O segundo capítulo desta tese visa responder a perguntas que surgiram durante a primeira metade deste trabalho, mas ao invés de focar no genoma de uma planta optamos por trabalhar com linhagem Del de LTR-RT em dez genomas de angiospermas sequenciados. Os resultados desta parte do trabalho foram submetidos para publicação no artigo intitulado ''Virus-like attachment sites and plastic CpG islands: landmarks of diversity in plant Del retrotransposons''. Os resultados mostraram que a LTR é uma região dinâmica e importante para a evolução dos LTR-RTs. Nós especulamos que mudanças nas LTR atuem como gatilhos para a diversificação dos LTR-RTs
- Imprenta:
- Data da defesa: 09.05.2014
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ABNT
CRUZ, Guilherme Marcello Queiroga. Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar. 2014. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-27012015-084619/. Acesso em: 28 jan. 2026. -
APA
Cruz, G. M. Q. (2014). Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-27012015-084619/ -
NLM
Cruz GMQ. Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar [Internet]. 2014 ;[citado 2026 jan. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-27012015-084619/ -
Vancouver
Cruz GMQ. Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar [Internet]. 2014 ;[citado 2026 jan. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-27012015-084619/
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