Variações de novo e raras no genoma de pacientes com transtornos do espectro do autismo verbais e não verbais (2014)
- Authors:
- Autor USP: REIS, VIVIANE NERI DE SOUZA - FM
- Unidade: FM
- Sigla do Departamento: MPS
- DOI: 10.11606/D.5.2014.tde-08122014-121628
- Subjects: AUTISMO; EXONS; VARIAÇÃO GENÉTICA; LINGUAGEM; PSIQUIATRIA
- Keywords: Autism; Exoma; Exons; Genetic variant; High-throughput nucleotide sequencing; Language; Linguagem; Psiquiatria; Psychiatry; Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala; Transtorno autístico; Variação genética; Variações do número de cópias do DNA; Variant of copies number DNA
- Language: Português
- Abstract: Estudos de gêmeos e famílias demonstram que os transtornos do espectro do autismo (TEA) apresentam um grande componente genético (~50%), porém sua etiologia ainda é desconhecida, possivelmente devido aos TEA serem caracterizados como doenças complexas, poligênicas e multifatoriais. Recentemente, variações no número de cópias (CNVs, do inglês Copy Number Variations) e mutações pontuais (SNV, do inglês Single Nucleotide Variant) raras, de novo e herdadas foram associadas com TEA, sugerindo novos loci e genes candidatos. No entanto, a grande maioria das alterações descritas são individuais, de forma que analises por agrupamento das mesmas em genes, e busca de funções biológicas ou vias hiper-representadas tem sido uma abordagem para a compreensão dos possíveis mecanismos etiopatológicos dos TEA. Como os TEA são muito heterogêneos clinicamente o uso de endofenótipos específicos para agrupamento das alterações gênicas pode auxiliar a discriminação de vias e processos biológicos relacionados a dimensões fenotípicas. Considerando os estudos realizados em autismo, e a natureza das variações comuns e raras, nesse trabalho foi realizado o sequenciamento do exoma de 1 família de dois irmãos com TEA sindrômico (sequenciamento piloto) e 18 trios de casos esporádicos de TEA, em busca alterações muito raras e/ou de novo com provável impacto funcional nos pacientes; Além disso, foi analisado se existe diferença entre as vias biológicas hiper-representadas de redes gênicas crescidas a partirdos genes que apresentavam variações raras e de novo, comparando pacientes de TEA com: (1) pouca ou nenhuma comunicação, chamados de não verbais e (2) média a boa comunicação, chamados de verbais. No sequenciamento piloto da família dos irmãos com TEA sindrômico, encontramos 1 duplicação em 4p16.3 e 1 deleção em 8p23.3, em ambos os irmãos; alterações estas encontradas em estudos previos em pacientes com características sindrômicas e TEA; na análise de SNVs e Indels foi encontrada 1 variação de novo e 117 variações não-sinônimas raras herdadas de um dos pais na irmã e 150 variações não-sinônimas raras herdadas de um dos pais no irmão; a análise de vias revelou que os genes com as mutações pontuais raras estavam hiper-representados em regiões cromossômicas diferentes em cada irmão (no cromossomo 1 na paciente do sexo feminino e no cromossomo 16 no paciente do sexo masculino), o que pode estar relacionado às diferenças fenotípicas por eles apresentadas. No sequenciamento do exoma dos trios foram encontradas alterações de novo em 9 dos pacientes: 1 CNV de novo (deleção) de 1,5Mb na região 3q29, região previamente associada com síndrome e transtornos do desenvolvimento; e 8 genes alterados por mutações pontuais de novo, dos quais um dele é o GABBR2, que apresenta evidência de associação com TEA. A análise de vias e redes das variantes herdadas raras, mostrou que muitos dos genes relacionados aos dois grupos verbais e não verbais são genes já associados com TEA ou que apresentaminteração com aqueles genes associados ao TEA. As analises de vias e redes precisam ser replicadas em amostras maiores, mas com nossos resultados preliminares podemos perceber que nosso estudo contribui com alterações em genes de vias relacionadas a neurogênese e sinaptogênese, independentemente do fenótipo, que possam refletir um conjunto de genes específicos e ou numero de alterações relacionadas a gravidade do TEA
- Imprenta:
- Data da defesa: 30.09.2014
- Status:
- Artigo publicado em periódico de acesso aberto (Gold Open Access)
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- Versão publicada (Published version)
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ABNT
REIS, Viviane Neri de Souza. Variações de novo e raras no genoma de pacientes com transtornos do espectro do autismo verbais e não verbais. 2014. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-08122014-121628/. Acesso em: 12 abr. 2026. -
APA
Reis, V. N. de S. (2014). Variações de novo e raras no genoma de pacientes com transtornos do espectro do autismo verbais e não verbais (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-08122014-121628/ -
NLM
Reis VN de S. Variações de novo e raras no genoma de pacientes com transtornos do espectro do autismo verbais e não verbais [Internet]. 2014 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-08122014-121628/ -
Vancouver
Reis VN de S. Variações de novo e raras no genoma de pacientes com transtornos do espectro do autismo verbais e não verbais [Internet]. 2014 ;[citado 2026 abr. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-08122014-121628/
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