Estudo via dinâmica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metileno em membrana modelo de POPC (2013)
- Authors:
- Autor USP: SIANI, PAULO - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 593
- Subjects: DINÂMICA; MOLÉCULA; CORANTES FLUORESCENTES (ESTUDO;PROPRIEDADES)
- Language: Português
- Abstract: O presente trabalho estuda por dinâmica molecular as propriedades estruturais e dinâmicas de corantes catiônicos da classe das fenotiazinas imersos em bicamada de fosfolipídeo. Dentre as fenotiazinas estudadas, destaca-se o azul de metileno (AM), um corante comercial que aliado à exposição de luz, obteve sucesso no tratamento de tumores e, dentro da mesma classe, um corante obtido pela metilação do azul de metileno nas posições 1 e 9 do anel, denominado 1,9dimetil azul de metileno (DMAM), que apresentou experimentalmente maior fotocitotoxicidade quando comparado ao azul de metileno. Foram comparadas as dinâmicas moleculares do AM e DMAM, avaliando suas semelhanças e diferenças, tais como suas interações com a bicamada fosfolipídica de 1-palmitoil-2-oleoil-snglicero-3-fosfocolina (POPC), posições preferenciais na bicamada, bem como sua vizinhança e orientação espacial; Posteriormente, foram estimadas variações de energia livre de Helmholtz para o processo de transferência do AM e DMAM, do meio aquoso para regiões específicas da bicamada. A energia livre total foi dissecada em termos eletrostático e não-eletrostáticos, utilizando-se do sinergismo entre os métodos de energia livre ABF (do inglês, Adaptive Biasing Force), TI (do inglês, Thermodynamic Integration) e FEP (do inglês, Free Energy Perturbation), procurando uma melhor compreensão dos fatores envolvidos na transferência entre os meios. Por último, foi proposta uma metodologia alternativa para cálculo do trabalho reversível eletrostático de solutos carregados
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2013
- Data da defesa: 20.12.2013
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ABNT
SIANI, Paulo. Estudo via dinâmica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metileno em membrana modelo de POPC. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2013. . Acesso em: 14 out. 2024. -
APA
Siani, P. (2013). Estudo via dinâmica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metileno em membrana modelo de POPC (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Siani P. Estudo via dinâmica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metileno em membrana modelo de POPC. 2013 ;[citado 2024 out. 14 ] -
Vancouver
Siani P. Estudo via dinâmica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metileno em membrana modelo de POPC. 2013 ;[citado 2024 out. 14 ] - Simulação computacional por dinâmica molecular de biomembranas lipídicas: extensão e validação de modelos coarse-grained para lipídios hidroperoxidados e colesterol
- Parameterization of a coarse-grained model of cholesterol with point-dipole electrostatics
- Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation
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