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Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos (2014)

  • Authors:
  • Autor USP: VERGANI, NAJA - IB
  • Unidade: IB
  • Sigla do Departamento: BIO
  • Subjects: CROMOSSOMO X; GENES; EXPRESSÃO GÊNICA; TRIAGEM; GENOMAS; MODELOS ANIMAIS; DNA; CROMATINA
  • Keywords: Epigenética; Epigenetics; Genomic functional screening; ICX; Inativação do cromossomo X; Next generation sequencing; NGS; Sequenciamento de próxima geração; Triagem genômica funcional; X chromosome inactivation; XCI
  • Language: Português
  • Abstract: A compensação da dosagem gênica entre fêmeas XX e machos XY em mamíferos é adquirida através de um complexo mecanismo epigenético que resulta na inativação de grande parte de um dos cromossomos X nas células femininas. O processo de inativação do cromossomo X (XCI) se inicia cedo durante a embriogênese, concomitantemente à diferenciação celular, e envolve a aquisição de modificações epigenéticas características do cromossomo X inativo (Xi). Uma estabelecido, o padrão de inativação é estavelmente mantido através de todas as mitoses celulares subsequentes e por toda a vida do organismo (exceto para células germinativas que sofrem reativação do Xi). Os mecanismos envolvidos na iniciação e estabelecimento da XCI foram extensivamente estudados, especialmente em camundongos. Embora algumas características epigenéticas associadas à manutenção da XCI tenham sido descritas, a identidade e modo específico de ação de fatores envolvidos durante essa fase da XCI são aspectos ainda não bem compreendidos. Além disso, o processo de XCI apresenta diferenças importantes entre humanos e camundongos e estudos direcionados para a identificação de novos componentes envolvidos na manutenção da XCI em humanos tornam-se de fundamental importância. Triagens funcionais genômicas por bibliotecas de shRNAs constituem uma ferramenta poderosa para a identificação de genes envolvidos em diferentes mecanismos celulares e vias bioquímicas. Sendo assim, utilizamos essa ferramenta para triar genes envolvidosna manutenção da XCI em humanos. Células somáticas femininas primárias HPRT+/-/HPRT- foram transduzidas com uma biblioteca lentiviral de shRNAs e posteriormente tratadas em meio de cultura contendo a droga HAT para seleção de células HPRT+ nas quais esperava-se que o cromossomo Xi presente tivesse sofrido reativação em decorrência do knockdown de genes envolvidos na manutenção da XCI. Essa estratégia nos permitiu identificar 20 novos genes candidatos a estarem envolvidos na manutenção da XCI. Esses candidatos deverão ser avaliados individualmente para confirmar seu papel no processo de controle epigenético do cromossomo X
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 01.04.2014
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      VERGANI, Naja; CARRAMASCHI, Lygia da Veiga Pereira. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos. 2014.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/ >.
    • APA

      Vergani, N., & Carramaschi, L. da V. P. (2014). Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/
    • NLM

      Vergani N, Carramaschi L da VP. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/
    • Vancouver

      Vergani N, Carramaschi L da VP. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/

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