Influência de dois elementos de transposiçãona arquitetura do genoma de Schistosoma mansoni (2014)
- Authors:
- Autor USP: JACINTO, DANIELE SANTINI - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCI
- Subjects: SCHISTOSOMA; BIOINFORMÁTICA; GENOMAS
- Keywords: Bioinformatics; Transposons
- Language: Português
- Abstract: Elementos transponíveis são elementos genéticos capazes de transpor para diferentes locais em um genoma hospedeiro. Na sua descoberta, considerou-se que tais elementos não presentavam funções celulares úteis, classificando-os como genes parasitas. Atualmente, além do caracter deletério, reconhece-se que eles contribuam para a evolução dos genomas e, em alguns casos, podem realizar algumas funções celulares. Utilizando recursos de bioinformática, realizamos estudos para verificar a influência de duas famílias de retrotransposons non-LTR (Perere-3 e SR2) no genoma do Schistosoma mansoni. Estudos preliminares indicam que apóss a divergência entre S. japonicum e S. mansoni, esses elementos tiveram uma grande expansão em seu número de cópias em S. mansoni, sem paralelo em S. japonicum. Análises das regiões intrônicas que contêm inserções de qualquer uma destas duas famílias de retrotransposon em S. mansoni, mostrou que houve aproximadamente 30% de aumento no tamanho dos íntrons e aumento do conteúdo GC, quando comparado com os íntrons ortólogos de S. japonicum. As inserções foram diferencialmente representadas ao longo das estruturas dos genes com a acumulação preferencial nos íntrons localizados nas regiões terminais dos genes. As inserções dos dois elementos de transposição tendem a orientar-se na direção oposta da transcrição dos genes. As inserções de trechos do elemento SR2 enriquecidos em motivos CpG foram observados com maior frequência do que o esperado, sugerindo que estas inserções podem contribuir nas funções de genes. Nas regiões intergênicas, foi possível prever sítios para ligação de fatores de transcrição ao longo das sequências de ambos os retrotransposons. Também foi observando que elementos SR2 tendem a se fixar em regiões que flanqueiam genes codificando proteínas transmembranares, as quais podem ser envolvidas na relação hospedeiro-parasita. Usando dados de transcrição deS. mansoni disponíveis publicamente, foram detectados 94 casos possíveis de exonização de inserções dos retrotransposons, produzindo mudanças do produto proteico. Estes resultados sugerem que os elementos Perere-3 e SR2 podem promover mudanças funcionais e estruturais relevantes nos genes de S. mansoni e pode ter contribuído significativamente para a diferenciação entre S. mansoni e S. japonicum
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2014
- Data da defesa: 25.04.2014
-
ABNT
JACINTO, Daniele Santini. Influência de dois elementos de transposiçãona arquitetura do genoma de Schistosoma mansoni. 2014. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26062014-151100/. Acesso em: 29 dez. 2025. -
APA
Jacinto, D. S. (2014). Influência de dois elementos de transposiçãona arquitetura do genoma de Schistosoma mansoni (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26062014-151100/ -
NLM
Jacinto DS. Influência de dois elementos de transposiçãona arquitetura do genoma de Schistosoma mansoni [Internet]. 2014 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26062014-151100/ -
Vancouver
Jacinto DS. Influência de dois elementos de transposiçãona arquitetura do genoma de Schistosoma mansoni [Internet]. 2014 ;[citado 2025 dez. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26062014-151100/ - Estudo comparativo da arquitetura dos genomas de Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum utilizando recursos bioinformáticos
- Estudo comparativo da arquitetura dos genomas de Schistosoma mansoni e Schitosoma japonicum utilizando recursos bioinformáticos
- Influence of two transposable elements in the genome architecture of Schistosoma mansoni
- Estudo comparativo das arquiteturas dos genomas de Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum utilizando recursos bioinformáticos
- Estudo comparativo da arquitetura dos genomas de Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum utilizando recursos bioinformáticos
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