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Metagenome of Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions (2014)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: MENDES, LUCAS WILLIAM - CENA
  • Unidades: CENA
  • Subjects: BACTÉRIAS; BIOINFORMÁTICA; BIOLOGIA MOLECULAR; DESMATAMENTO; ECOLOGIA MICROBIANA; ECOLOGIA MOLECULAR; FLORESTAS TROPICAIS; MANEJO DO SOLO; MICROBIOLOGIA DO SOLO; USO DO SOLO
  • Language: Inglês
  • Abstract: A floresta Amazônica é considerada o maior reservatório de biodiversidade vegetal e animal do mundo, porém, nos últimos anos tem sido submetida à altas taxas de desmatamento para a conversão de áreas de mata nativa em campos de agricultura e pastagem. A compreensão sobre os efeitos dessa mudança de uso da terra sobre as comunidades microbianas do solo é fundamental, levando-se em consideração a importância que esses organismos desempenham no ecossistema. Neste contexto, este trabalho de tese avaliou o efeito dessas mudanças sobre as comunidades de micro-organismos em solos sob diferentes sistemas de uso. No primeiro estudo, as comunidades microbianas foram analisadas por meio do sequenciamento de nova geração Illumina Hiseq2000, sendo consideradas amostras de áreas de floresta nativa, área desmatada, agricultura e pastagem. A partir da análise de aproximadamente 487 milhões de sequências foi possível mostrar que as comunidades microbianas respondem diferentemente em cada sistema de uso do solo, com alterações tanto na diversidade taxonômica quanto funcional. Também, sugere-se que o funcionamento do ecossistema em solos de floresta é mantido pela abundância dos micro-organismos presentes, enquanto nas áreas alteradas esse funcionamento é mantido pela alta diversidade e redundância funcional. No segundo estudo foi avaliado até que ponto uma espécie de planta, i.e. soja, é capaz de selecionar a comunidade habitante de sua rizosfera. A partir do sequenciamento metagenômico pelaplataforma 454 GS FLX Titanium da Roche foi investigado a diversidade taxonômica e funcional das comunidades de solo e rizosfera associadas à soja, e testou-se a validade das teorias neutras e de nicho para explicar o processo de formação das comunidades microbianas. Os resultados sugerem que a soja seleciona uma comunidade específica que habita sua rizosfera com base em atributos funcionais, os quais podem estar relacionados com benefícios à planta, como promoção do crescimento e nutrição. Esse processo de seleção segue a teoria de nicho, indicando o poder de seleção da planta e de outras variáveis ambientais em moldar as comunidades microbianas tanto de forma taxonômica quanto funcional. Esta tese destaca a importância de estudos em ecologia microbiana no contexto da Amazônia para uma melhor compreensão dos efeitos do desmatamento sobre os microrganismos e disponibiliza informações que podem ser futuramente utilizados para o desenvolvimento de metodologias mais sustentáveis para o uso do ecossistema
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 11.04.2014
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    • ABNT

      MENDES, Lucas William; MUI, Tsai Siu; KURAMAE, Eiko Eurya. Metagenome of Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions. 2014.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2014. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11062014-144747/ >.
    • APA

      Mendes, L. W., Mui, T. S., & Kuramae, E. E. (2014). Metagenome of Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11062014-144747/
    • NLM

      Mendes LW, Mui TS, Kuramae EE. Metagenome of Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11062014-144747/
    • Vancouver

      Mendes LW, Mui TS, Kuramae EE. Metagenome of Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11062014-144747/


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