Caracterização molecular de uma cianobactéria baseada em sequências dos genes rRNA 16S e cpcBA (2004)
- Authors:
- Autor USP: FIORE, MARLI DE FATIMA - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: CYANOPHYTA; BIOLOGIA MOLECULAR
- Language: Português
- Abstract: Caracterizar através de sequências gênicas uma cianobactéria da Mata Atlântica do Estado de São Paulo e estabelecer sua relação filogenética com outras linhagens desse grupo de microrganismo. Material e/ou métodos: O DNA da cianobactéria foi extraído usando 0,5 mg de massa seca coletada no tronco de uma árvore da Mata Atlântica. Para a amplificação por PCR do gene rRNA 16S e de uma região do espaço intergênico da ficocianina (cpcBA) existentes no DNA extraído, utilizou-se os iniciadores 27F1/1494Rc e PCBF/PCaR, respectivamente. Os produtos da PCR obtidos foram clonados e sequenciados. O alinhamento e a construção da árvore filogenética foram realizados usando o programa CLUSTAL W. Resultados: A análise BLAST da sequência gerada do gene rRNA 16S da cianobactéria mostrou 96% de identidade com Symphyonemopsis VAPOR1 e a identidade da sequência de cpcBA foi de 86% com Synechocystis PCC9413. Na árvore filogenética a cianobactéria formou um clado com Symphyonemopsis VAPOR1 altamente sustentado pelo valor de reamostragem (99%). A sequência cpcBA dessa cianobactéria formou um clado único na árvore. Conclusões: Pela análise do rRNA 16S a cianobactéria foi incluída dentro da ordem Stignomatales, no gênero Symphyonemopsis e pode representar uma nova espécie. A falta de sequências de cpcBA de cianobactérias da ordem Stignomatales nos bancos de dados públicos não possibilitou fazer a identificação da cianobactéria usando o espaço intergênico da ficocianina
- Imprenta:
- Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo - SIICUSP
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ABNT
SILVA, Camila Lazarini Portela e et al. Caracterização molecular de uma cianobactéria baseada em sequências dos genes rRNA 16S e cpcBA. 2004, Anais.. São Paulo: USP, 2004. Disponível em: https://uspdigital.usp.br/siicusp/cdOnlineTrabalhoObter?numeroInscricaoTrabalho=3304&numeroEdicao=12&print=S. Acesso em: 26 jul. 2024. -
APA
Silva, C. L. P. e, Ferreira, D. B., Sant'Anna, C. L., Silva, C. S. P. da, Lorenzi, A. S., & Fiore, M. de F. (2004). Caracterização molecular de uma cianobactéria baseada em sequências dos genes rRNA 16S e cpcBA. In . São Paulo: USP. Recuperado de https://uspdigital.usp.br/siicusp/cdOnlineTrabalhoObter?numeroInscricaoTrabalho=3304&numeroEdicao=12&print=S -
NLM
Silva CLP e, Ferreira DB, Sant'Anna CL, Silva CSP da, Lorenzi AS, Fiore M de F. Caracterização molecular de uma cianobactéria baseada em sequências dos genes rRNA 16S e cpcBA [Internet]. 2004 ;[citado 2024 jul. 26 ] Available from: https://uspdigital.usp.br/siicusp/cdOnlineTrabalhoObter?numeroInscricaoTrabalho=3304&numeroEdicao=12&print=S -
Vancouver
Silva CLP e, Ferreira DB, Sant'Anna CL, Silva CSP da, Lorenzi AS, Fiore M de F. Caracterização molecular de uma cianobactéria baseada em sequências dos genes rRNA 16S e cpcBA [Internet]. 2004 ;[citado 2024 jul. 26 ] Available from: https://uspdigital.usp.br/siicusp/cdOnlineTrabalhoObter?numeroInscricaoTrabalho=3304&numeroEdicao=12&print=S - Detection of non-ribosomally assembled toxic cyanopeptides
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