Exportar registro bibliográfico

Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em xilanases da família 11 (2013)

  • Authors:
  • Autor USP: CENSONI, LUCIANO BORGES - IFSC
  • Unidade: IFSC
  • Sigla do Departamento: FCM
  • Subjects: REDES COMPLEXAS; PROTEÍNAS
  • Keywords: Centralidade; Centrality; Complex networks; Difusão térmica; Proteins; Thermal diffusion; Xilanases; Xylanases
  • Language: Português
  • Abstract: Proteínas tipicamente são capazes de manter a sua conformação funcional somente dentro de um intervalo limitado de temperaturas. A despeito do maquinário sofisticado de manutenção da homeostase celular, é sabido que uma variedade de fenômenos moleculares são capazes de induzir desequilíbrios localizados de energia vibracional, e que a eficiência com que cada proteína dissipa estas perturbações pode estar relacionada com a sua tolerância a altas temperaturas. No entanto, a transferência de energia térmica entre diferentes segmentos de uma cadeia proteica é difícil de caracterizar experimentalmente. Uma alternativa teórica para a investigação destes mecanismos é o emprego de simulações de Dinâmica Molecular, particularmente associadas à técnica de Difusão Térmica Anisotrópica (ATD). Aqui, verificamos a possibilidade de empregar conceitos da teoria de Redes Complexas para construir modelos para estruturas de proteínas, e por meio destes identificar resíduos com capacidade significativa de dissipar perturbações térmicas. Investigamos os diversos protocolos de construção de modelos de rede para proteínas encontrados na literatura, e utilizamos dados experimentais representativos da base SCOP para calcular com rigor os parâmetros numéricos necessários. Produzimos uma definição precisa para o conceito de contato entre resíduos de aminoácidos, e a partir desta calculamos a centralidade de cada resíduo. Com isto, demonstramos que, em um conjunto de Xilanases para as quais dispomos de dados de ATD, a capacidade de difundir perturbações térmicas é fortemente correlacionada com a centralidade de proximidade de cada resíduo, fornecendo argumentos para o uso de modelos de rede para estudar a termoestabilidade de proteínas
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 25.07.2013
  • Acesso à fonte
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      CENSONI, Luciano Borges; MARTÍNEZ, Leandro. Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em xilanases da família 11. 2013.Universidade de São Paulo, São Carlos, 2013. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-25092013-093104/ >.
    • APA

      Censoni, L. B., & Martínez, L. (2013). Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em xilanases da família 11. Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-25092013-093104/
    • NLM

      Censoni LB, Martínez L. Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em xilanases da família 11 [Internet]. 2013 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-25092013-093104/
    • Vancouver

      Censoni LB, Martínez L. Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em xilanases da família 11 [Internet]. 2013 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-25092013-093104/

    Últimas obras dos mesmos autores vinculados com a USP cadastradas na BDPI:

    Digital Library of Intellectual Production of Universidade de São Paulo     2012 - 2021