Análise in-silico de rearranjos cromossômicos em células B selvagens e ‘53BP POT. -/-’ comparadas com linfomas de células B ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ utilizando sequenciamento em larga escala (2013)
- Authors:
- Autor USP: OLIVEIRA, THIAGO YUKIO KIKUCHI - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: NEOPLASIAS; GENOMAS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; LINFOMA
- Language: Português
- Abstract: Rearranjos cromossômicos, incluindo translocações, requerem a formação e junção de quebras de DNA dupla fita (DNA double strand breaks ou DSBs). Esses eventos abalam a integridade do genoma e estão frequentemente envolvidos com o desenvolvimento de leucemias, linfomas e sarcomas. Apesar de importância deste tipo de evento, o conhecimento de sua gênese é limitado. Sabe-se que deficiências em fatores que regulam a reposta ao dano no DNA (DNA damage responso ou DDR) aumentam a incidência de malignidades pela desestabilização do genoma. No entanto, a influencia da resposta ao dano no DNA na regulação de rearranjos associados ao câncer não está bem definida. Para examinar a origem de rearranjos cromossômicos foi desenvolvido o método de captura de translocações denominado Translocation Capture Sequencing ou TC-Seq, que é capaz de rastrear rearranjos em células primárias. Em seguida, analisamos o impacto genômico da proteína 53BP1 em linfomas. Enquanto a enzima AID (actiuation-ind uced cytidine deaminase) e a proteína 53BP1 estão relacionados com câncer em humanos, apenas a hiperexpressão de AID ou somente a perda do gene 53BP1 é insuficiente para causar a malignidade. No entanto, a combinação de ambos resulta em linfomas de célula B. Sequenciamento em larga escala de células tumorais ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ e TC-Seq de células B primárias ‘53BP1 POT. -/-’ revelaram que seu rearranjo cromossômico difere daqueles encontrados em células selvagens e outros tumores de célula B, mostrando que 53BP1 aumenta a ressecção das extremidade do DNA. Além disso, a perda de 53BP1 altera o translocatoma aumentando os rearranjos com regiões intergênicas
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2013
- Data da defesa: 13.05.2013
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ABNT
OLIVEIRA, Thiago Yukio Kikuchi. Análise in-silico de rearranjos cromossômicos em células B selvagens e ‘53BP POT. -/-’ comparadas com linfomas de células B ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ utilizando sequenciamento em larga escala. 2013. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2013. . Acesso em: 18 out. 2024. -
APA
Oliveira, T. Y. K. (2013). Análise in-silico de rearranjos cromossômicos em células B selvagens e ‘53BP POT. -/-’ comparadas com linfomas de células B ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ utilizando sequenciamento em larga escala (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Oliveira TYK. Análise in-silico de rearranjos cromossômicos em células B selvagens e ‘53BP POT. -/-’ comparadas com linfomas de células B ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ utilizando sequenciamento em larga escala. 2013 ;[citado 2024 out. 18 ] -
Vancouver
Oliveira TYK. Análise in-silico de rearranjos cromossômicos em células B selvagens e ‘53BP POT. -/-’ comparadas com linfomas de células B ‘53BP1 POT. -/-’ e ‘P53 POT. -/-’ utilizando sequenciamento em larga escala. 2013 ;[citado 2024 out. 18 ]
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