Caracterização da estrutura e regulação dos genes MGC16121 e CR5964 71 (2013)
- Authors:
- Autor USP: MUYS, BRUNA RODRIGUES - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: NEOPLASIAS; EXPRESSÃO GÊNICA; REGULAÇÃO GÊNICA; RNA; BIOMARCADORES
- Keywords: Câncer; Genes MGC16121 e CR596471; RNAs não codificadores; MGC16121 and CR596471 genes; Biomarkers; Gene expression; Non-coding RNAs
- Language: Português
- Abstract: Os genes MGC16121 e CR596471 localizam-se no cromossomo X (Xq26) entre os loci HPRTI e PLACI, uma região rica em genes associados com a reprodução humana. A importância de tais genes reside na possibilidade de estarem envolvidos no desenvolvimento placentário e fetal e de serem expressos em poucos tecidos normais. Camundongos portadores de deleções próximas do gene ortólogo HPRTI de humanos apresentam cerca de um terço do tamanho dos camundongos selvagens ou em alguns casos são natimortos. No entanto, este fenótipo não é observado quando o gene está mutado. Assim, pode-se supor que o fenótipo anormal das cobaias não é resultado da deficiência do HPR TI, mas sim de genes e/ou microRNAs (miRNAs) próximos a ele. Estes resultados abrem perspectivas em relação ao estudo dos genes MGC16121, CR596471 e miRNAs das vizinhanças. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a estrutura, a expressão e o mecanismo de regulação por metilação dos genes MGC16121 e CRS96471. Adicionalmente foram analisados quanto ao perfil de expressão e regulação por metilação os miRNAs das vizinhanças (miR-424, 503, 450a, 450b-5p e 542-3p). O gene MGC16121 mostrou-se específico de placenta e também expresso em 50% das 18 linhagens tumorais analisadas. Já CR596471 e os miRNAs das vizinhanças foram mais expressos em placenta do que qualquer outro tecido normal analisado, sendo o primeiro expresso também em 100% das linhagens tumorais avaliadas. Houve correlação positiva e significativa entre todos os genes e miRNAs em relação à expressão em tecidos normais, porém o mesmo não foi observado para linhagens tumorais. A respeito da regulação, os genes CR596471 e MGC16121 e os miRNAs miR-424, 503 e 450a foram regulados negativamente por metilação do DNA em pelo menos uma das três linhagens tratadas com o agente demetilante 5-aza-2-deoxicitidina. Apoiando este Lato, os dinucleotídeos CpG das ilhas CpGssituadas próximas às regiões 5' dos genes CR596471 e MGC16121 foram pelo menos em parte desmetilados após o mesmo tratamento.Os dados relativos à estrutura primária dos genes indicam que os transcritos, apesar de serem lncRNAs apresentaram características de mRNAs. Para MGC16121 foi determinado um transcrito composto de 3 éxons e, para CR596471, um transcrito composto de 3 éxons e outro composto de 2 éxons. Os transcritos aqui determinados são relativamente conservados quando comparados a sequências de RNA encontradas em outros mamíferos, principalmente em primatas. Adicionalmente, o transcrito de MGC16121 possui subestruturas secundários visivelmente semelhantes com aquelas dos transcritos homólogos encontrados em alguns primatas. De acordo com os resultados, o gene MGC16121 pode ser considerado um possível bom marcador para diagnóstico, prognóstico e talvez para terapias contra canceres. Todavia, mais experimentas devem ser realizados para verificar a função dos genes MGC16212 e CR5976471, além de avaliar mais robustamente a capacidade do gene MGC16121 ser utilizado como ferramenta na medicina contra o cancer
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2013
- Data da defesa: 10.06.2013
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ABNT
MUYS, Bruna Rodrigues. Caracterização da estrutura e regulação dos genes MGC16121 e CR5964 71. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-29082013-142331/. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Muys, B. R. (2013). Caracterização da estrutura e regulação dos genes MGC16121 e CR5964 71 (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-29082013-142331/ -
NLM
Muys BR. Caracterização da estrutura e regulação dos genes MGC16121 e CR5964 71 [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-29082013-142331/ -
Vancouver
Muys BR. Caracterização da estrutura e regulação dos genes MGC16121 e CR5964 71 [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-29082013-142331/
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