Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar (2013)
- Authors:
- Autor USP: COSTA, DIOGO PAES DA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LSO
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; ECOLOGIA MICROBIANA; GENES; MUDANÇA CLIMÁTICA; RIZOSFERA; RNA RIBOSSÔMICO; SISTEMAS DE CULTIVO
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar é uma cultura importante no contexto agrário brasileiro, sobretudo com relação a manutenção e sustentabilidade dos agroecossistemas e da biodiversidade do solo. As comunidades microbianas associadas à canade- açúcar são participantes da manutenção dos ciclos biogeoquímicos, podendo ter sua estrutura e diversidade alteradas por mudanças no manejo da cultura e nas condições climáticas. Esse estudo teve como objetivo avaliar a diversidade microbiana associada à rizosfera de diferentes genótipos de cana-de-açúcar e empregar a metodologia de Stable Isotope Probing (DNA-SIP) para se avaliar a estrutura dos grupos responsivos a este ambiente. Para tanto, variedades de cana-de-açúcar foram selecionadas, extraindo-se o DNA total rizosférico e do bulk soil para análise por PCR-DGGE das regiões do gene 16S rDNA de bactérias, selecionando-se amostras representativas para o sequenciamento da região V6 do gene 16S rDNA através da plataforma Ion Torrent(TM). Os resultados demonstraram diferenças entre a diversidade das comunidades microbianas da rizosfera e do bulk soil, havendo a predominância dos grupos Actinobacteria, Proteobacteria e Acidobateria. Para o estudo da estrutura dos grupos responsivos na rizosfera, plantas da variedade RB86-7515 foram cultivadas sob duas concentrações de CO2 (350 e 700 ppm), realizando-se o enriquecimento com 13CO2, e posteriormente realizando a extração do DNA rizosférico para aplicação na técnica de DNA-SIP. A eficiência desta técnica foiavaliada por meio da técnica de PCR-DGGE para as regiões 16S rDNA de bactérias e ITS de fungos, onde foi verificado que após 48 horas já ocorre a incorporação de 13C pelas comunidades microbianas, havendo diferença entre os grupos que incorporaram o 13C. Diferenças foram também observadas para as distintas concentrações de CO2, indicando o DNA-SIP como uma poderosa ferramenta de estudos da ecologia das comunidades microbianas na rizosfera de cana-deaçúcar
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2013
- Data da defesa: 24.01.2012
-
ABNT
COSTA, Diogo Paes da. Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11140/tde-15032013-083716/. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Costa, D. P. da. (2013). Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11140/tde-15032013-083716/ -
NLM
Costa DP da. Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11140/tde-15032013-083716/ -
Vancouver
Costa DP da. Descrição da comunidade microbiana associada à rizosfera de cana-de-açúcar [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11140/tde-15032013-083716/
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