Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina (2012)
- Authors:
- Autor USP: PERSINOTI, GABRIELA FELIX - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: FUNGOS MITOSPORICOS; IMUNIDADE; RNA; VIRULÊNCIA
- Keywords: Trichophyton rubrum; Acriflavina; Fatores de Virulência; RNA-seq; Trichophyton rubrum; Acriflavine; Virulence factors
- Language: Português
- Abstract: O dermatófito Trichophyton rubrum é um fungo filamentos , antropofílico que infecta preferencialmente tecidos queratinizados, e é o agente etiológica mais frequentemente isolado em casos de dermatofitoses humanas. Recentemente, este fungo tornou-se a causa de infecções profundas e generalizadas em pacientes imunocomprometidos. As estratégias terapêuticas para controlar esse tipo de infecção apresentam várias limitações, como o aparecimento de linhagens resistentes e o número restrito de alvos celulares disponíveis. Novas estratégias terapêuticas são necessárias, sendo o foco de muitas investigações. Acriflavina é uma droga citotóxica com atividade antifúngica envolvida na inibição da topoisomerase. Embora seja um composto intercalante de DNA, já foi relatada a super expressão de genes que codificam enzimas envolvidas no transporte de elétrons na cadeia respiratório mitocondrial e no transporte de ferro em resposta a esta droga, sugerindo um amplo espectro de efeitos celulares. A fim de melhor compreender seus efeitos moleculares, o objetivo deste trabalho foi avaliar o transcriptoma de T. rubrum em resposta a acriflavina. Os perfis transcricionais em resposta a esta droga foram analisados utilizando a metodologia de RNA-seq empregando o sequenciamento em larga escala SOLiD System. Foram comparadas quatro bibliotecas sendo uma o cultivo de T. rubrum em meio Sabouraud e três períodos de exposição à droga: 3 horas, 12 horas e 24 horas. Foram geradas aproximadamente 200 milhões de reads, as quais foram filtradas e alinhadas no genoma de T. rubrum disponível no Dermatophyte Comparative Database - Broad Institute utilizando os algoritmos Bowtie e Tophat. As reads alinhadas foram processadas utilizando os algoritmos Cufflinks e Cuiffdiff para estimar a abundância dos transcritos e testar os genes diferencialmente expressos entre o controle e as condições de exposição à droga. Foramidentificados 3.153 genes diferencialmente expressos. Após o estabelecimento de critérios mais estringentes, foram selecionados 490 genes diferencialmente expressos em resposta à droga. Estes genes estão relacionados a vários processos celulares como reações de oxidação e redução, transporte transmembrana, transporte de tons e metais e a patogenicidade. Os genes envolvidos com patogenicidade foram reprimidos, sugerindo que a droga interfira com processos importantes para instalação e manutenção da infecção no hospedeiro. Outros fatores de virulência como genes envolvidos no ciclo do glioxilato, também foram reprimidos pela droga. Além disso, genes da via de biossíntese do ergosterol foram reprimidos pela droga, o que constitui um provável novo mecanismo de ação de acriflavina. Os resultados obtidas nesta análise em larga escala contribuem com a elucidação dos mecanismos moleculares envolvidos na adaptação ao estresse em dermatófitos e podem auxiliar o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas. Além disso, estes resultados contribuem com a anotação do genoma e transcritoma de T. rubrum e outros dermatófitos
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2012
- Data da defesa: 07.12.2012
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ABNT
PERSINOTI, Gabriela Felix. Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina. 2012. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-22042013-113234/. Acesso em: 09 out. 2024. -
APA
Persinoti, G. F. (2012). Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-22042013-113234/ -
NLM
Persinoti GF. Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina [Internet]. 2012 ;[citado 2024 out. 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-22042013-113234/ -
Vancouver
Persinoti GF. Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina [Internet]. 2012 ;[citado 2024 out. 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-22042013-113234/
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