Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico (2011)
- Authors:
- Autor USP: RECCHIA, GUSTAVO HENRIQUE - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; DNA COMPLEMENTAR; EXPRESSÃO GÊNICA; FATORES DE TRANSCRIÇÃO; METABOLISMO CELULAR; PROTEÍNAS DE TRANSPORTE; PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO DO CÁLCIO; RESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETAL
- Language: Português
- Abstract: O Brasil é o segundo maior produtor de feijão, sendo a espécie mais cultivada o Phaseolus vulgaris L. Entre as três possíveis safras exploradas no Brasil, aquela que gera a maior produção é a da seca. Por outro lado, como a maioria das lavouras emprega pouca tecnologia, um dos problemas desta cultura é o estresse hídrico, que leva a uma redução na produtividade. Dessa forma, a identificação de genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água seria de grande utilidade. Nos últimos anos, muitas informações ômicas do feijoeiro foram geradas, criando uma visão integrada deste organismo e oferecendo uma complexa rede de interações entre genes e seus produtos. Este trabalho teve como objetivo central à identificação de genes diferencialmente expressos no sistema radicular de um genótipo de feijoeiro resistente ao estresse hídrico (BAT 477), quando submetido a uma interrupção de irrigação durante seu desenvolvimento. Foi construída uma biblioteca subtrativa de cDNA (SSH), que representou os genes diferencialmente expressos no genótipo resistente, utilizando-se como driver o genótipo Carioca 80SH (suscetível a seca). Foram obtidos 1572 reads válidos, sendo 931 destes singletons e 189 contigs com uma média de seis reads por cluster. A anotação das sequências foi conduzida via BLASTX, sendo consideradas para anotação somente os melhores resultados dos produtos gênicos similares com E- Value '<OU=' 10-5. A classificação funcional foi feita tendo-se como base modelos descritos para plantas (modelo CS e MIPS) e os resultados foram agrupados em seis classes funcionais distintas. As análises de bioinformática ajudaram na identificação de genes descritos como envolvidos na resposta da planta ao estresse hídrico.Entre eles: proteínas do grupo LEA; fatores de transcrição como DREB, NAC e proteínas ricas em leucina; enzimas sintetizadoras de carboidratos incluindo trehalose, sacarose e rhamnose; proteínas ricas em prolina; receptores de hormônios (ABA, etileno); aquaporinas; chaperonas; ubiquitinas; nodulinas; e proteínas associadas à fotossíntese e à respiração. A fim de se obter a validação das ESTs anotadas, foi conduzido um experimento de PCR em tempo real confrontando os padrões de expressão de 15 genes sob quatro tratamentos: ambos os genótipos sob estresse e respectivos controles. Três replicatas biológicas foram adotadas e dois genes de referência (act e skip2) foram escolhidos para normalização interna dos dados. Os padrões de expressão gênica obtidos confirmam a hipótese de que tais genes são mesmo mais expressos no genótipo resistente, embora não sejam exclusivos já que uma quantidade menor de tais transcritos também foi detectada no genótipo suscetível
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2011
- Data da defesa: 03.06.2011
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ABNT
RECCHIA, Gustavo Henrique. Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico. 2011. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2011. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11102011-085802/. Acesso em: 24 jan. 2026. -
APA
Recchia, G. H. (2011). Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11102011-085802/ -
NLM
Recchia GH. Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico [Internet]. 2011 ;[citado 2026 jan. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11102011-085802/ -
Vancouver
Recchia GH. Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico [Internet]. 2011 ;[citado 2026 jan. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-11102011-085802/ - Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico
- DREB genes from common bean (Phaseolus vulgaris L.) show broad to specific abiotic stress responses and distinct levels of nucleotide diversity
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