Caracterização e modelagem de redes biológicas geográficas (2011)
- Authors:
- Autor USP: VIANA, MATHEUS PALHARES - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Subjects: TEORIA DOS GRAFOS; PROCESSAMENTO DE IMAGENS; REDES COMPLEXAS; BIOLOGIA (SISTEMAS)
- Language: Português
- Abstract: Nesta tese apresentamos uma metodologia de mapeamento capaz de gerar representações em termos de grafos para sistemas biológicos de conectividade complexa. Tais sistemas são inicialmente armazenados na forma de imagens digitais e em seguida submetidos a um pré-processamento com objetivo de padronizar as imagens. As imagens pré-processadas são então utilizadas para gerar modelos tridimensionais dos sistemas de interesse. Um algoritmo de propagação de rótulos é utilizado para extrair os esqueletos dos modelos volumétricos e estes esqueletos são por fim, representados por um grafo, composto por vértices e arestas. Os vértices e arestas desse grafo armazenam propriedades do sistema original, como posição, comprimento e diâmetro, bem como as características topológicas de tais sistemas. Finalmente, os grafos resultantes são estudados através da teoria das redes complexas, dentro de um contexto específico para cada sistema. Nossos procedimentos foram aplicados com sucesso a diferentes sistemas biológicos, como artérias caríotidas, árvores arteriais, estruturas mitocondriais e poros em amostras de solo
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2011
- Data da defesa: 23.03.2011
-
ABNT
VIANA, Matheus Palhares. Caracterização e modelagem de redes biológicas geográficas. 2011. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2011. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-23052011-082033/. Acesso em: 13 nov. 2024. -
APA
Viana, M. P. (2011). Caracterização e modelagem de redes biológicas geográficas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-23052011-082033/ -
NLM
Viana MP. Caracterização e modelagem de redes biológicas geográficas [Internet]. 2011 ;[citado 2024 nov. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-23052011-082033/ -
Vancouver
Viana MP. Caracterização e modelagem de redes biológicas geográficas [Internet]. 2011 ;[citado 2024 nov. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-23052011-082033/
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