Simulações microcanônicas de proteínas (2010)
- Authors:
- Autor USP: FRIGORI, RAFAEL BERTOLINI - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 591
- Subjects: PROTEÍNAS; FÍSICA COMPUTACIONAL; MÉTODO DE MONTE CARLO (APLICAÇÕES)
- Language: Português
- Abstract: Transições de fase termodinâmicas são usualmente estudadas por meio do ensemble canônico e estão associadas a sistemas macroscópicos. Entretanto, tem-se tornado cada vez mais frequente e importante o estudo de sistemas físicos "pequenos", cujos alcances característicos das interações equivalem aos tamanhos dos sistemas. Nestes casos pode haver inequivalência entre grandezas físicas obtidas nos ensembles canônico e microcanôniconico. Encontramos inúmeros exemplos destes sistemas em diversas áreas da Física. Na área de matéria condensada temos, por exemplo, o modelo Blume-Capel com interações de alcance infinito. Neste modelo as soluções exatas canônica e microcanônica são inequivalentes. Este modelo é investigado nesta tese por meio de um ensemble interpolante, conhecido como gaussiano estendido, como uma aplicação teórica preliminar. Adicionalmente, empregamos o arcabouço mecânico-estatístico no estudo de certas biomoléculas com ampla importância biológica: proteínas. Atualmente o estudo do comportamento termodinâmico destas moléculas tem ficado restrito quase que exclusivamente a abordagem via ensemble canônico. Neste trabalho analisamos os resultados da etapa microcanônica de simulações microcanônicas procurando obter aspectos físicos de biomoléculas como os domínios Src SH3 (pdb: 1NLO) e as Príons humanas (pdb: 1HJM). Caracterizarmos com esta abordagem as transições de fase de enovelamento e de agregação destes sistemas. Os resultados obtidos são interpretados á luz datermoestatatística microcanônica, oferecendo um ponto de vista fenomenológico alternativo á abordagem usual
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2010
- Data da defesa: 21.12.2010
-
ABNT
FRIGORI, Rafael Bertolini. Simulações microcanônicas de proteínas. 2010. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2010. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-27012011-185248/. Acesso em: 19 set. 2024. -
APA
Frigori, R. B. (2010). Simulações microcanônicas de proteínas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-27012011-185248/ -
NLM
Frigori RB. Simulações microcanônicas de proteínas [Internet]. 2010 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-27012011-185248/ -
Vancouver
Frigori RB. Simulações microcanônicas de proteínas [Internet]. 2010 ;[citado 2024 set. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-27012011-185248/
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