Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas (2009)
- Authors:
- Autor USP: CANTÃO, MAURICIO EGIDIO - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- Assunto: BIOINFORMÁTICA
- Language: Português
- Abstract: Devido à grande diversidade de microrganismos desconhecidos no meio ambiente, 99% deles não podem ser cultivados nos meios de cultura tradicionais dos laboratórios. Para isso, projetos metagenômicos são propostos para estudar comunidades microbianas presentes no meio ambiente, a partir de técnicas moleculares, em especial o sequenciamento. Dessa forma, para os próximos anos é esperado um acúmulo de seqüências produzidas por esses projetos. As seqüências produzidas pelos projetos genomas e metagenomas apresentam vários desafios para o tratamento, armazenamento e análise, como exemplo: a busca de clones contendo genes de interesse. Este trabalho apresenta uma abordagem algébrica que define e gerencia de forma dinâmica as regras para seleção de clones em bibliotecas genômicas e metagenômicas que se baseiam em álgebra de processos. Além disso, uma interface web foi desenvolvida para permitir que os pesquisadores criem e executem facilmente suas próprias regras de seleção de clones em bancos de dados de seqüências genômicas e metagenômicas. Este software foi testado em bibliotecas genômicas e metagenômicas e foi capaz de selecionar clones contendo genes de interesse.
- Imprenta:
- Data da defesa: 01.12.2009
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ABNT
CANTÃO, Maurício Egídio. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2009. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17092010-123112/. Acesso em: 19 jul. 2024. -
APA
Cantão, M. E. (2009). Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17092010-123112/ -
NLM
Cantão ME. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas [Internet]. 2009 ;[citado 2024 jul. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17092010-123112/ -
Vancouver
Cantão ME. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas [Internet]. 2009 ;[citado 2024 jul. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17092010-123112/
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