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Predição in silico de epítopos de microrganismos com identidade a autoantígenos humanos (2010)

  • Authors:
  • Autor USP: BREVE, ANDRÉ LUIS DA SILVA - FMRP
  • Unidade: FMRP
  • Sigla do Departamento: RGE
  • Subjects: BIOINFORMÁTICA; DOENÇAS IMUNOLÓGICAS; MIMETISMO; EPITOPOS; ANTÍGENOS
  • Language: Português
  • Abstract: A origem das doenças autoimunes é multifatorial, sendo que envolve condições ambientais e predisposição genética, dificultando sua identificação. Muitos pesquisadores têm estudado a associação entre agentes infecciosos e autoimunidade, a qual pode ser disparada pelo processo conhecido por mimetismo molecular. Neste caso, respostas imunes cruzadas envolvendo antígenos próprios têm sido documentadas. O presente projeto tem como objetivo a busca in silico por associações entre epítopos de microrganismos e autoantígenos humanos. Iniciaram-se as análises pela identificação de semelhanças de sequências de aminoácidos entre epítopos de microrganismos e autoantígenos humanos por meio do alinhamento local de sequências efetuado pelo programa BLASTP. As sequências de epítopos dos microrganismos e autoantígenos humanos foram previamente adquiridas nos bancos de dados Immune Epitope Database and Analysis Resource (IEDB) e no Genbank, respectivamente. Foram também realizadas modelagens de estruturas proteicas para o antígeno e o autoantígeno que obtiveram melhores valores de alinhamento, com base no valor do E-value, por meio dos programas Modeller e Rosetta. Por fim, a predição de epítopos foi executada, pelo uso dos softwares NetMHC e NetMHCII, para avaliar a possibilidade de epítopos de microrganismos e de autoantígenos humanos se associarem aos mesmos alelos de HLA. Como resultado, foram encontradas similaridades tanto de sequências proteicas quanto de afinidade a 4 tipos de alelos de HLA entre um epítopo do antígeno LSA-1 de Plasmodium falciparum e o autoantígeno de miosina, o que sugere uma associação entre eles, atingindo o objetivo deste trabalho
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 31.03.2010
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      BREVE, André Luis da Silva; GIULIATTI, Silvana. Predição in silico de epítopos de microrganismos com identidade a autoantígenos humanos. 2010.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2010. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-26052011-113627/?&lang=pt-br >.
    • APA

      Breve, A. L. da S., & Giuliatti, S. (2010). Predição in silico de epítopos de microrganismos com identidade a autoantígenos humanos. Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-26052011-113627/?&lang=pt-br
    • NLM

      Breve AL da S, Giuliatti S. Predição in silico de epítopos de microrganismos com identidade a autoantígenos humanos [Internet]. 2010 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-26052011-113627/?&lang=pt-br
    • Vancouver

      Breve AL da S, Giuliatti S. Predição in silico de epítopos de microrganismos com identidade a autoantígenos humanos [Internet]. 2010 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-26052011-113627/?&lang=pt-br

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