Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (2010)
- Authors:
- Autor USP: PALHARES, ALESSANDRA CAROLINA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; GENOMAS; MAPEAMENTO GENÉTICO; MARCADOR MOLECULAR; POLIMORFISMO
- Language: Português
- Abstract: No presente trabalho, AFLPs e marcadores baseados em retrotransposons foram utilizados para a construção de um mapa de ligação integrado em cana-de-açúcar. Dois retrotransposons encontrados no genoma da cana-de-açúcar, denominados SURE e Garapa, foram estudados. Os princípios da técnica NBS-profiling foram usados para gerar marcadores direcionados às sequências desses retrotransposons. Os marcadores foram analisados numa população F1 de cana-de-açúcar, composta por 188 indivíduos, oriunda do cruzamento entre os genitores IAC66-6 e TUC71-7. O mapa integrado foi construído usando-se o software OneMap, especialmente desenvolvido para mapear espécies não endogâmicas. Excelentes padrões de AFLP e de marcas direcionadas ao retrotransposon SURE foram obtidos; entretanto, para o Garapa, ainda são necessários ajustes na técnica. Um total de 600 marcadores de dose única foi obtido a partir de 22 combinações de enzimas de restrição/primers de AFLP e seis combinações otimizadas para amplificar marcas direcionadas ao retrotransposon SURE. Construiu-se um mapa com 107 grupos de ligação, com tamanho de 4.316,5 cM e densidade de 8,74 cM/marcador. O mapeamento dos marcadores derivados do retrotransposon SURE revelou que esse elemento não está uniformemente distribuído nos grupos de ligação e confirmou o seu baixo número de cópias no genoma da cana, conforme foi sugerido na literatura
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2010
- Data da defesa: 17.05.2010
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ABNT
PALHARES, Alessandra Carolina. Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2010. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2010. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-24052010-105229/. Acesso em: 26 jan. 2026. -
APA
Palhares, A. C. (2010). Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-24052010-105229/ -
NLM
Palhares AC. Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) [Internet]. 2010 ;[citado 2026 jan. 26 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-24052010-105229/ -
Vancouver
Palhares AC. Mapeamento genético de marcadores AFLP e de retrotransposons em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) [Internet]. 2010 ;[citado 2026 jan. 26 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-24052010-105229/
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