Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias (2010)
- Authors:
- Autor USP: GABRIEL, PAULO HENRIQUE RIBEIRO - ICMC
- Unidade: ICMC
- Sigla do Departamento: SSC
- Subjects: COMPUTAÇÃO EVOLUTIVA; TEMPO-REAL; ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS
- Language: Português
- Abstract: A predição de estruturas de proteínas (Protein Structure Prediction PSP) é um problema computacionalmente complexo. Para tratar esse problema, modelos simplificados de proteínas, como o Modelo HP, têm sido empregados para representar as conformações e Algoritmos Evolutivos (AEs) são utilizados na busca por soluções adequadas para PSP. Entretanto, abordagens utilizando AEs muitas vezes não tratam adequadamente as soluções geradas, prejudicando o desempenho da busca. Neste trabalho, é apresentada uma formulação multiobjetivo para PSP em Modelo HP, de modo a avaliar de forma mais robusta as conformações produzidas combinando uma avaliação baseada no número de contatos hidrofóbicos com a distância entre os monômeros. Foi adotado o Algoritmo Evolutivo Multiobjetivo em Tabelas (AEMT) a fim de otimizar essas métricas. O algoritmo pode adequadamente explorar o espaço de busca com pequeno número de indivíduos. Como consequência, o total de avaliações da função objetivo é significativamente reduzido, gerando um método para PSP utilizando Modelo HP mais rápido e robusto
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2010
- Data da defesa: 23.03.2010
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ABNT
GABRIEL, Paulo Henrique Ribeiro. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias. 2010. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2010. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-14052010-143653/. Acesso em: 03 jan. 2026. -
APA
Gabriel, P. H. R. (2010). Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-14052010-143653/ -
NLM
Gabriel PHR. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias [Internet]. 2010 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-14052010-143653/ -
Vancouver
Gabriel PHR. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias [Internet]. 2010 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-14052010-143653/
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