Implementação da análise de acoplamentos estatísticos e sua aplicação á família de proteínas tirosina fosfatases (2009)
- Authors:
- Autor USP: BLEICHER, LUCAS - IFSC
- Unidade: IFSC
- Subjects: PROTEÍNAS; ESTATÍSTICA COMPUTACIONAL; ANÁLISE ESTATÍSTICA DE DADOS
- Language: Português
- Abstract: A Análise de Acoplamentos Estatísticos é uma técnica computacional capaz de identificar resíduos importantes para a estrutura e função de proteínas em uma família por meio da quantificação de conservação posicional, correlação entre posições e identificação de grupos de resíduos correlacionados entre si. Neste trabalho, a análise de acoplamentos estatísticos foi implementada e aplicada ao estudo das proteínas tirosina fosfatases. Em conjunto com as proteínas tirosina quinases (PTKs), que adicionam um grupo fosforil a um resíduo de tirosina em uma proteína, as proteínas tirosina fosfatases (PTPs), que o removem, são responsáveis por diversos processos de sinalização celular.Elas são um caso de evolução convergente, onde um subgrupo (as proteínas tirosina fosfatases de baixo peso molecular) não apresenta homologia às chamadas PTPs "clássicas", capazes de defosforilar apenas resíduos de tirosina, e às fosfatases de especifidicade dupla, capazes de defosforilar também resíduos de serina e treonina, além de substratos não-protéicos.Em comum, as três subfamílias apresentam apenas o motivo 'C"X IND.5"R', característico para todas as PTPs.Através do estudo das três subfamílias utilizando a análise de acoplamentos estatísticos, foi possível obter uma descrição detalhada de suas características conservadas e correlacionadas, relacionando-as ao conhecimento acumulado sobre proteínas tirosina fosfatases e a questões em aberto como a regulação por dimerização, a especificidadee mutações relacionadas a patologias. Foi possível também apresentar um método capaz de distinguir proteínas tirosina fosfatases de baixo peso molecular das arsenato redutases, derivadas das primeiras por evolução divergente. ) Adicionalmente, a técnica foi aplicada ao estudo das hexoquinases, às superóxido dismutases e às peroxidases.A tese descreve também estudos desenvolvidos pelo autor na área de cristalografia de proteínas - a determinação das estruturas da Transtirretina humana em complexo com genisteína, da holo-Hexoquinase PI de S.cerevisae, do complexo IL-22/IL-22R1 e da Laminarinase de R. marinus
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2009
- Data da defesa: 09.03.2009
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ABNT
BLEICHER, Lucas. Implementação da análise de acoplamentos estatísticos e sua aplicação á família de proteínas tirosina fosfatases. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2009. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26032009-130135/. Acesso em: 01 dez. 2025. -
APA
Bleicher, L. (2009). Implementação da análise de acoplamentos estatísticos e sua aplicação á família de proteínas tirosina fosfatases (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26032009-130135/ -
NLM
Bleicher L. Implementação da análise de acoplamentos estatísticos e sua aplicação á família de proteínas tirosina fosfatases [Internet]. 2009 ;[citado 2025 dez. 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26032009-130135/ -
Vancouver
Bleicher L. Implementação da análise de acoplamentos estatísticos e sua aplicação á família de proteínas tirosina fosfatases [Internet]. 2009 ;[citado 2025 dez. 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-26032009-130135/
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