Emprego de redes neurais e de descritores moleculares em quimiotaxonomia da família Asteraceae (2008)
- Authors:
- Autor USP: SCOTTI, MARCUS TULLIUS - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QFL
- Subjects: PRODUTOS NATURAIS; QUIMIOTAXONOMIA; REDES NEURAIS; BOTÂNICA (CLASSIFICAÇÃO)
- Language: Português
- Abstract: Esse trabalho descreve o desenvolvimento de uma nova ferramenta quimioinformática designada de SISTEMATX que possibilitou a análise quimiotaxonômica da família Asteraceae, empregando novos parâmetros moleculares, bem como o estudo da relação quantitativa estrutura química - atividade biológica de substâncias provenientes desse grupo vegetal. A família Asteraceae, uma das maiores entre as angiospermas, caracteriza-se quimicamente pela produção de sesquiterpenos lactonizados (SLs). Um total de 1111 (SLs), extraídos de 658 espécies, 161 gêneros, 63 subtribos e 15 tribos da família Asteraceae foram representados e cadastrados em duas dimensões no SISTEMATX e associados à respectiva origem botânica. A partir dessa codificação, o grau de oxidação e as estruturas em três dimensões de cada SL foram obtidos pelo sistema. Essas informações, associadas aos dados botânicos, foram exportadas para um arquivo texto, o qual permitiu a obtenção de vários tipos de descritores moleculares. Esses parâmetros moleculares foram correlacionados com o grau de oxidação médio por tribo e tiveram sua seleção realizada por regressão linear múltipla utilizando algoritmo genético. Equações com coeficientes estatísticos variando entre 0,725 'MAIOR IGUAL' 'r POT.2' 'MAIOR IGUAL' 0,981 e 0,647 'MAIOR IGUAL' Q'C IND.POT.cv 2' 'MAIOR IGUAL' 0,725 foram obtidas com apenas um descritor, possibilitando a identificação de algumas características estruturais relacionadas ao grau de oxidação. Não foiobtida nenhuma relação entre o grau de oxidação dos SL e a evolução das tribos da família Asteraceae. Os descritores moleculares também foram usados como dados de entrada para separar as ocorrências botânicas através de mapas auto-organizáveis (rede não supervisionada Kohonen). Os mapas gerados, com cada bloco de descritor, separaram as tribos da família Asteraceae com valores de índices de acerto total entre 66,7'POR CENTO' e 83,6'POR CENTO'. ) A análise desses resultados evidencia semelhanças entre as tribos Heliantheae, Helenieae, e Eupatorieae e, também, entre as tribos Anthemideae e Inuleae. Tais observações são coincidentes com as classificações sistemáticas propostas por Bremer, que utilizam principalmente dados morfológicos e, também, moleculares. A mesma abordagem foi utilizada para separar os ramos da tribo Heliantheae, segundo a classificação proposta por Stuessy, cuja separação é baseada no número de cromossomos das subtribos. Os mapas auto-organizáveis obtidos separam em duas regiões distintas os ramos A e C, com elevados índices de acerto total que variam entre 81,79 'POR CENTO' a 92,48 'POR CENTO'. Ambos os estudos demonstram que os descritores moleculares podem ser utilizados como uma ferramenta para classificação de táxons em níveis hierárquicos baixos, tais como tribos e subtribos. Adicionalmente, foi demonstrado que os marcadores químicos corroboram parcialmente com as classificações que empregam dados morfológicos e moleculares. Osdescritores obtidos por fragmentos ou pela representação da estrutura dos SLs em duas dimensões foram suficientes para obtenção de resultados significativos, não sendo obtida melhora nos resultados com os descritores que utilizam a representação em três dimensões das estruturas. Paralelamente, um estudo adicional foi realizado relacionando a estrutura química, representada pelos mesmos descritores moleculares anteriormente mencionados, com a atividade citotóxica de 37 SLs frente às células tumorais da nasofaringe KB. Uma equação com índices estatísticos significativos ('r POT.2'=0,826 e 'Q IND.POT.cv 2' 'IGUAL'0,743) foi obtida. Os cinco descritores, selecionados a partir de uma equação estatisticamente mais significativa, representam uma descrição global de propriedades estéricas e características eletrônicas de cada molécula que auxiliaram na determinação ) de fragmentos estruturais importantes para a atividade citotóxica. Tal modelo permitiu verificar que os esqueletos carbônicos dos tipos guaianolídeo e pseudoguaianolídeo são encontrados nos SLs que apresentam maior atividade citotóxica
- Imprenta:
- Data da defesa: 18.07.2008
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ABNT
SCOTTI, Marcus Tullius. Emprego de redes neurais e de descritores moleculares em quimiotaxonomia da família Asteraceae. 2008. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2008. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46135/tde-26112008-110912/. Acesso em: 09 maio 2024. -
APA
Scotti, M. T. (2008). Emprego de redes neurais e de descritores moleculares em quimiotaxonomia da família Asteraceae (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46135/tde-26112008-110912/ -
NLM
Scotti MT. Emprego de redes neurais e de descritores moleculares em quimiotaxonomia da família Asteraceae [Internet]. 2008 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46135/tde-26112008-110912/ -
Vancouver
Scotti MT. Emprego de redes neurais e de descritores moleculares em quimiotaxonomia da família Asteraceae [Internet]. 2008 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46135/tde-26112008-110912/ - Estudo de propriedades físico-químicas e de critérios para obtenção e validação de modelos QSAR para séries de análogos de semicarbazonas com atividade antichagásica, retiradas da literatura
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