Variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies b e c associados à infecção respiratória aguda, em São Paulo, nos anos de 1995 a 2005 (2008)
- Authors:
- USP affiliated authors: HARSI, CHARLOTTE MARIANNA - ICB ; DURIGON, EDISON LUIZ - ICB
- Unidade: ICB
- Assunto: MICROBIOLOGIA
- Language: Português
- Abstract: Objetivos: Analisar a variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies B e C, associados a casos de infecção respiratória aguda, durante o período de 1995 a 2005. Métodos e Resultados: Amostras de secreção nasal foram colhidas de crianças durante os anos de 1995 à 2005, totalizando 2732 amostras. O DNA viral foi extraído pelo método de Shinagawa et al. Para detecção e caracterização dos HAdVs foi utilizada PCR descrita por Lu & Erdman, 2006. HadVs foram detectados em 597 amostras, sendo 421 espécie B, 227 espécie C e 6 espécie E . Infecções mistas foram detectadas em 61 amostras. Para análise da variabilidade genética destes adenovírus, 4 regiões do genoma viral foram escolhidas, sendo estas, representativas dos processos envolvidos na infecção do hospedeiro e eficácia da atividade viral. Para amplificação destes genes, pares de primers foram elaborados. As reações de amplificação foram padronizadas. Após análise em gel de agarose, o produto de PCR foi purificado e sequenciado. Os produtos obtidos foram precipitados e analisados através dos aparelhos ABI Prism 3130 e 3100. As sequencias obtidas foram alinhadas e comparadas com outras sequencias depositadas em bancos de dados. Reconstruções filogenéticas foram realizadas nos programas Mega4 e Paup. Variabilidades nucleotídicas foram observadas em todos os genes estudados, atraves de mecanismos de recombinação, substituições nucleotídicas, deleções e inserções. Conclusão: Adenovírus das espécies B e C foramdetectados em aproximadamente 22% das amostras analisadas. Processos evolutivos foram observados em todas as regiões gênicas estudas.
- Imprenta:
- Publisher: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP
- Publisher place: São Paulo
- Date published: 2008
- Source:
- Título do periódico: Resumos
- Conference titles: Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo
-
ABNT
MARINHEIRO, J. C.; CARVALHO, D.; SACRAMENTO, P. R.; et al. Variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies b e c associados à infecção respiratória aguda, em São Paulo, nos anos de 1995 a 2005. Anais.. São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP, 2008. -
APA
Marinheiro, J. C., Carvalho, D., Sacramento, P. R., Lu, X., Giglio, A., Vieira, S. E., et al. (2008). Variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies b e c associados à infecção respiratória aguda, em São Paulo, nos anos de 1995 a 2005. In Resumos. São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP. -
NLM
Marinheiro JC, Carvalho D, Sacramento PR, Lu X, Giglio A, Vieira SE, Botosso VF, Durigon EL, Erdman DD, Hársi CM. Variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies b e c associados à infecção respiratória aguda, em São Paulo, nos anos de 1995 a 2005. Resumos. 2008 ; -
Vancouver
Marinheiro JC, Carvalho D, Sacramento PR, Lu X, Giglio A, Vieira SE, Botosso VF, Durigon EL, Erdman DD, Hársi CM. Variabilidade genética de adenovírus humanos das espécies b e c associados à infecção respiratória aguda, em São Paulo, nos anos de 1995 a 2005. Resumos. 2008 ; - PCR for screening of adenovirus in respiratory infections directly from clinical samples
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