Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal (2007)
- Authors:
- Autor USP: BRITO, GLAUBER DA COSTA DE - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QBQ
- Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; EXPRESSÃO GÊNICA (ANÁLISE); GENOMAS; RNA (ESTUDO;CARACTERÍSTICAS); TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Language: Português
- Abstract: O carcinoma de célula renal (CCR) subtipo célula clara é o câncer mais letal e prevalente do sistema urinário. A transformação maligna no CCR está possivelmente associada à mudanças no perfil de expressão de oncogenes e genes supressores de tumor, e acredita-se que estas alterações sejam críticas para o desenvolvimento do fenótipo maligno. Para identificar novos genes e vias moleculares associadas à transformação maligna no CCR célula clara, foram analisados perfis de expressão gênica de amostras pareadas de tumor e tecido não tumoral adjacente de 6 pacientes. Foi utilizada uma plataforma de microarrays de cDNA contendo 2.292 sondas mapeando éxons de genes codificadores e 822 sondas de RNAs não-codificadores mapeando em regiões intrônicas. A transcrição intrônica foi detectada em todos os tecidos normais e neoplásicos. Utilizando uma combinação de dois testes estatísticos e uma validação por leave-one-out, foi selecionado um subconjunto de 64 transcritos com expressão significativamente alterada em CCR célula clara em relação ao tecido não tumoral adjacente, estando a maior parte (´86 POR CENTO´) com expressão diminuída em CCR. Entre os transcritos com expressão diminuída, 49 mapearam em regiões não-traduzidas ou éxons de genes codificadores e 6 mapearam em regiões intrônicas de genes codificadores conhecidos. Os níveis de expressão diminuída de SIN3B, TRIP3, SYNJ2BP e NDE1 (p < 0,02), e de transcritos intrônicos derivados dos loci de SND1 e ACTN4 (p < 0,05),foram confirmados em CCR célula clara por Real-time RT-PCR. Um subconjunto de 25 transcritos se mostrou alterado em 6 amostras adicionais de CCR não-célula clara, indicando alterações transcricionais comuns em CCR independentemente do subtipo histológico ou do estado de diferenciação do tumor. Além disso, foi analisado o perfil de metilação dos genes com expressão diminuída em tumor SIN3B, TRIP3, SYNJ2BP e GPX3. Nossos resultados indicam um novo ) conjunto de candidatos a gene supressor de tumor, que podem desempenhar um papel importante na transformação maligna de células renais normais
- Imprenta:
- Data da defesa: 26.11.2007
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ABNT
BRITO, Glauber Costa. Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal. 2007. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2007. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-07022008-100457/. Acesso em: 12 mar. 2026. -
APA
Brito, G. C. (2007). Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-07022008-100457/ -
NLM
Brito GC. Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal [Internet]. 2007 ;[citado 2026 mar. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-07022008-100457/ -
Vancouver
Brito GC. Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal [Internet]. 2007 ;[citado 2026 mar. 12 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-07022008-100457/
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