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Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNP K e ligantes (2008)

  • Authors:
  • Autor USP: SILVA, VINICIUS BARRETO DA - FCFRP
  • Unidade: FCFRP
  • Sigla do Departamento: S/D
  • Subjects: NEOPLASIAS; MODELAGEM MOLECULAR; FÁRMACOS (PLANEJAMENTO)
  • Language: Português
  • Abstract: O Projeto Genoma Humano do Câncer (PGHC), financiado pela FAPESP e pelo Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o câncer, buscou identificar os genes expressos nos tipos mais comuns de câncer no Brasil. Tal projeto conseguiu identificar aproximadamente um milhão de seqüências de genes de tumores freqüentes no Brasil. A contribuição brasileira foi maior para tumores de cabeça e pescoço, mama e cólon. Uma das iniciativas mais recentes e estimuladas pelo PGHC é o projeto Genoma Clínico, o qual visa desenvolver novas formas de diagnóstico e tratamento do câncer através do estudo de genes expressos. A partir da análise molecular de tecidos saudáveis e neoplásicos em diferentes estágios, é possível identificar marcadores de prognóstico, permitindo escolhas de terapias mais adequadas e eficientes. A proteína hnRNP K foi identificada como um desses marcadores, em neoplasias da região da cabeça e pescoço, sendo objetivo deste estudo a aplicação de técnicas de bioinformática e modelagem molecular no planejamento baseado em estrutura de candidatos a fármacos antineoplásicos que bloqueiem a atividade da proteína. A proteína hnRNP K apresenta diversas funções e é encontrada nos mais diversos compartimentos celulares, interferindo, basicamente, no sistema de expressão gênica. Essa proteína apresenta 3 domínios KH, os quais são responsáveis por sua ligação à moléculas de DNA e RNA. Modelos de boa qualidade dos domínios KH foram construídos através da estratégia de modelagem molecular porhomologia estrutural. Após "screening" virtual em bases de dados de compostos (330.000 aproximadamente) com propriedades "drug-like", 15 compostos com potencial de interação com o domínio KH3 foram selecionados. Os modos de ligação para cada um dos mesmos no sítio ligante do domínio KH3 foram sugeridos por simulações de "docking" e apresentaram um bom encaixe espacial com os sítios receptores virtuais calculados pelos campos de interação ) molecular. Simulações de dinâmica molecular foram realizadas com o intuito de avaliar a estabilidade dos compostos selecionados, que também foram avaliados quanto à presença de grupamentos toxicofóricos em sua estrutura
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 17.04.2008
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      SILVA, Vinicius Barreto da; SILVA, Carlos Henrique Tomich de Paula da. Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNP K e ligantes. 2008.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2008. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60136/tde-02102008-164529/ >.
    • APA

      Silva, V. B. da, & Silva, C. H. T. de P. da. (2008). Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNP K e ligantes. Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60136/tde-02102008-164529/
    • NLM

      Silva VB da, Silva CHT de P da. Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNP K e ligantes [Internet]. 2008 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60136/tde-02102008-164529/
    • Vancouver

      Silva VB da, Silva CHT de P da. Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNP K e ligantes [Internet]. 2008 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60136/tde-02102008-164529/


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