Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni (2008)
- Autores:
- Autor USP: VENANCIO, THIAGO MOTTA - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- Assuntos: ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS; BIOINFORMÁTICA
- Agências de fomento:
- Idioma: Português
- Resumo: Schistosoma mansoni é um dos agentes causadores da esquistossomose, doença infecciosa negligenciada que afeta milhões de pessoas no mundo. É um platelminto parasitário dióico, com um complexo ciclo de vida, composto de seis estágios. Nos últimos cinco anos, projetos de seqüenciamento em larga escala de etiquetas de genes expressos (ESTs) de Schistosoma geraram uma quantidade razoável de dados que ainda pode ser mais bem explorada. O objetivo central deste trabalho é analisar computacionalmente a expressão gênica de S. mansoni, sob três focos distintos: (i) micro-arranjos de DNA, para os quais descrevemos o desenho e análise de dados de uma plataforma de cDNA (4,600 elementos) e outra de oligonucleotídeos (44,000 elementos). Estão também descritas diversas ferramentas de análise que implementamos e são amplamente usadas em nosso grupo. Os micro-arranjos têm servido de base para vários projetos, como o estudo da resposta do parasita a hormônios e drogas e expressão gênica durante o ciclo de vida. (ii) Identificação in silico de pares de transcritos senso- antisenso com possível ação em trans, potencialmente importantes na regulação gênica. (iii) Análises da coleção de ESTs existentes sob uma perspectiva evolutiva.Através dessa abordagem encontramos genes importantes como um possível inibidor de angiogênese e um regulador da via do mevalonato, conhecido como essencial para a produção de ovos; estes constituem a principal causa de morbidez da esquistossomose. Os resultados aqui apresentados contribuem para o entendimento da complexa biologia inerente ao ciclo de vida de S. mansoni e para acelerar a busca de futuras possibilidades de tratamento
- Imprenta:
- Data da defesa: 14.02.2008
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ABNT
VENANCIO, Thiago Motta. Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni. 2008. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2008. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-11032008-175724/. Acesso em: 01 out. 2024. -
APA
Venancio, T. M. (2008). Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-11032008-175724/ -
NLM
Venancio TM. Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni [Internet]. 2008 ;[citado 2024 out. 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-11032008-175724/ -
Vancouver
Venancio TM. Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni [Internet]. 2008 ;[citado 2024 out. 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-11032008-175724/
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