O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz (2007)
- Authors:
- Autor USP: SACCARO JUNIOR, NILO LUIZ - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIB
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; ARROZ; GENOMAS
- Language: Português
- Abstract: Os elementos transponíveis (TEs) constituem grande parte do material genético de diversos eucariotos, alcançando entre 50-80% do genoma de gramíneas. Os projetos genoma proporcionaram um aumento das informações disponíveis sobre estes elementos, o que evidenciou sua importância e possibilitou o desenvolvimento de novas abordagens para seu estudo. O sistema Mutator (Mu) de milho é o mais ativo e mutagênico transposon de plantas. Além do elemento autônomo, MuDR, o sistema compreende ainda um conjunto de elementos bastante heterogêneo em sua seqüência e estrutura, chamados MuLEs, que podem conter até mesmo fragmentos de genes do hospedeiro. As seqüências de transposons mais abundantemente expressas no transcriptoma de cana-de-açúcar são relacionadas a MuDR e se agrupam em quatro clados (nomeados Classes I, II, II e IV), existentes antes da divergência entre Mono e Eudicotiledôneas. O trabalho apresentado aqui teve o objetivo de aprofundar o conhecimento sobre o sistema Mutator em cana-de-açúcar a partir da análise comparativa entre seqüências dessa planta e de arroz (cujo genoma está totalmente seqüenciado). Foi possível avaliar a abundância e diversidade do sistema Mu em gramíneas, ficando evidente uma amplificação de elementos clado-específica, tendo a Classe II sofrido uma explosão no número de cópias ao longo da evolução destas plantas. Análises estruturais revelaram que, enquanto as Classes I e II compreendem elementos com características de transposons, asClasses III e IV são, na verdade, transposases domesticadas. Foram completamente seqüenciados dois clones de BAC de cana-de-açúcar, um proveniente de cada parental do híbrido (Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum), ambos contendo elementos da Classe III. Estes elementos foram caracterizados e a seqüência genômica de cana foi comparada com sua ortóloga em arroz, revelando um acúmulo de TEs nas regiões intergênicas
- Imprenta:
- Data da defesa: 27.11.2007
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ABNT
SACCARO JUNIOR, Nilo Luiz. O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz. 2007. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-30012008-113943/. Acesso em: 03 nov. 2024. -
APA
Saccaro Junior, N. L. (2007). O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-30012008-113943/ -
NLM
Saccaro Junior NL. O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz [Internet]. 2007 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-30012008-113943/ -
Vancouver
Saccaro Junior NL. O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz [Internet]. 2007 ;[citado 2024 nov. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-30012008-113943/
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