Tese

Métodos bayesianos aplicados em taxonomia molecular (2007)

• Authors:
  • Villanueva Talavera, Edwin Rafael
  • Maciel, Carlos Dias (Orientador)
• Autor USP: TALAVERA, EDWIN RAFAEL VILLANUEVA - EESC
• Unidade: EESC
• Sigla do Departamento: SEL
• Subjects: INFERÊNCIA BAYESIANA; ALGORITMOS; PROBABILIDADE APLICADA
• Language: Português
• Abstract: Neste trabalho são apresentados dois métodos de agrupamento de dados visados para aplicações em taxonomia molecular. Estes métodos estão baseados em modelos probabilísticos, o que permite superar alguns problemas apresentados nos métodos não probabilísticos existentes, como a dificuldade na escolha da métrica de distância e a falta de tratamento e aproveitamento do conhecimento a priori disponível. Os métodos apresentados combinam por meio do teorema de Bayes a informação extraída dos dados com o conhecimento a priori que se dispõe, razão pela qual são denominados métodos Bayesianos. O primeiro método, método de agrupamento hierárquico Bayesiano, está baseado no algoritmo HBC (Hierarchical Bayesian Clustering). Este método constrói uma hierarquia de partições (dendrograma) baseado no critério da máxima probabilidade a posteriori de cada partição. O segundo método é baseado em um tipo de modelo gráfico probabilístico conhecido como redes Gaussianas condicionais, o qual foi adaptado para problemas de agrupamento. Ambos métodos foram avaliados em três bancos de dados donde se conhece a rótulo da classe. Os métodos foram usados também em um problema de aplicação real: a taxonomia de uma coleção brasileira de estirpes de bactérias do gênero Bradyrhizobium (conhecidas por sua capacidade de fixar o 'N IND.2' do ar no solo). Este banco de dados é composto por dados genotípicos resultantes da análise do RNA ribossômico. Os resultados mostraram que o método hierárquicoBayesiano gera dendrogramas de boa qualidade, em alguns casos superior que o melhor dos algoritmos hierárquicos analisados. O método baseado em redes gaussianas condicionais também apresentou resultados aceitáveis, mostrando um adequado aproveitamento do conhecimento a priori sobre as classes tanto na determinação do número ótimo de grupos, quanto no melhoramento da qualidade dos agrupamentos
• Imprenta:
  • Publisher place: São Carlos
  • Date published: 2007
• Data da defesa: 31.08.2007


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How to cite

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• ABNT

  VILLANUEVA TALAVERA, Edwin Rafael. Métodos bayesianos aplicados em taxonomia molecular. 2007. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/18/18152/tde-03102007-105125/. Acesso em: 13 jun. 2025.

• APA

  Villanueva Talavera, E. R. (2007). Métodos bayesianos aplicados em taxonomia molecular (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/18/18152/tde-03102007-105125/

• NLM

  Villanueva Talavera ER. Métodos bayesianos aplicados em taxonomia molecular [Internet]. 2007 ;[citado 2025 jun. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/18/18152/tde-03102007-105125/

• Vancouver

  Villanueva Talavera ER. Métodos bayesianos aplicados em taxonomia molecular [Internet]. 2007 ;[citado 2025 jun. 13 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/18/18152/tde-03102007-105125/

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