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Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica (2007)

  • Authors:
  • Autor USP: LOPES, TIAGO JOSÉ DA SILVA - ICMC
  • Unidade: ICMC
  • Sigla do Departamento: SCE
  • Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; BIOINFORMÁTICA
  • Language: Português
  • Abstract: Neste trabalho desenvolvemos um novo algoritmo para clustering para dados de expressão gênica. As abordagens tradicionais utilizam um conjunto de dados na forma de uma tabela de duas dimensões, onde as linhas são os genes e as colunas são as condições experimentais. Nós utilizamos uma estrutura de três dimensões, acrescentando fatias de tempo. Implementamos nosso algoritmo e testamos com conjuntos de dados sintéticos e dados reais, usando índices de validação para comparar os resultados obtidos pelo nosso algoritmo com os resultados produzidos pelo algoritmo TriCluster. Os resultados mostraram que o nosso algoritmo é bom para dados de expressão gênica em três dimensões e pode ser aplicado a dados de outros domínios
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 29.03.2007
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      LOPES, Tiago José da Silva. Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica. 2007. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-09052007-155734/. Acesso em: 03 out. 2024.
    • APA

      Lopes, T. J. da S. (2007). Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-09052007-155734/
    • NLM

      Lopes TJ da S. Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica [Internet]. 2007 ;[citado 2024 out. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-09052007-155734/
    • Vancouver

      Lopes TJ da S. Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica [Internet]. 2007 ;[citado 2024 out. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-09052007-155734/

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