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Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri (2006)

  • Authors:
  • Autor USP: MOREIRA, LEANDRO MARCIO - IQ
  • Unidade: IQ
  • Sigla do Departamento: QBQ
  • Subjects: FITOPATÓGENOS (ANÁLISE); DNA; COMPOSTOS AROMÁTICOS; XANTHOMONAS (ANÁLISE)
  • Language: Português
  • Abstract: O cancro cítrico é uma doença que afeta diversas espécies de Citrus, cujo agente causal é Xanthomonas axonopodis pv citri (XAC). O genoma desta fitobactéria consiste de um cromossomo de 'DA ORDEM DE' 5 Mpb e dois plasmídeos, que juntos codificam 4313 CDS (seqüências codificadoras), das quais 2710 apresentam similaridade com proteínas conhecidas. Neste trabalho realizamos uma análise comparativa detalhada do genoma de XAC com genomas de três fitopatógenos, Xanthomonas campestris campestris, Xy/ella fastidiosa 9a5c e Xy/ella fastidiosa Temecula. Com esta análise identificamos genes espécie e gênero-específicos, potencialmente relevantes para adaptação aos seus respectivos nichos ou hospedeiros, além de ilhas de inserção e deleção genômica putativas. Também identificamos vias metabólicas relacionadas com osmoproteção/osmorregulação e com degradação de compostos aromáticos em XAC, que possivelmente são determinantes na eficácia de sua interação com o hospedeiro. Analisamos o nível de expressão de 9 CDS após crescimento de XAC em diferentes concentrações de glicose e verificamos que este açúcar modula positivamente a expressão de CDS relacionadas à síntese de goma e ao sistema de osmoproteção. Além disso, descrevemos a construção de microarranjos de DNA representando 2760 CDS de XAC, constituindo-se uma nova ferramenta para estudos de genômica comparativa e expressão gênica deste fitopatógeno
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 11.10.2006
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      MOREIRA, Leandro Marcio; DA SILVA, Aline Maria. Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2006.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2006. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-20042007-160036/ >.
    • APA

      Moreira, L. M., & Da Silva, A. M. (2006). Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-20042007-160036/
    • NLM

      Moreira LM, Da Silva AM. Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-20042007-160036/
    • Vancouver

      Moreira LM, Da Silva AM. Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-20042007-160036/

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