Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformatica (2006)
- Authors:
- Autor USP: SANCHES, PABLO RODRIGO - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FFI
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; EXPRESSÃO GÊNICA; PROCESSAMENTO DE DADOS
- Language: Português
- Abstract: Os projetos para estudo de genomas ou genes expressos partem de uma etapa de seqüenciamento no qual são gerados em laboratório dados brutos, ou seja, seqüências de DNA sem significado biológico. Estas seqüências de DNA possuem códigos responsáveis pela produção de RNAs e proteínas.O grande desafio dos pesquisadores consiste em analisar essas seqüências e obter informações biologicamente relevantes. Durante esta análise diversos programas de computador, além de um grande volume de dados armazenados em fontes de dados biológicas, são utilizados. Assim sendo, o presente trabalho propôs a elaboração de um sistema computacional que permite a análise de dados sobre biologia molecular e facilite a instanciação do software dependendo do ambiente de trabalho e tipo de projeto de análise. Para este sistema foi dado o nome de Sistema de Gerenciamento de Análise de Dados por Bioinformática - SGADBio.O trabalho apresenta o desenvolvimento do sistema baseado em metodologias de Engenharia de Software, além dos módulos e funções disponíveis. Seqüências oriundas de um projeto de ESTs do fungo dermatófito Trichophyton rubrum, geradas em um laboratório de biologia molecular, foram submetidas ao sistema para análise. Os resultados são expressivos, demonstrando que o sistema é adequado e capaz de adaptar-se a projetos envolvendo seqüenciamento
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2006
- Data da defesa: 10.10.2006
-
ABNT
SANCHES, Pablo Rodrigo. Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformatica. 2006. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2006. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27112014-115821/. Acesso em: 28 set. 2024. -
APA
Sanches, P. R. (2006). Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformatica (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27112014-115821/ -
NLM
Sanches PR. Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformatica [Internet]. 2006 ;[citado 2024 set. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27112014-115821/ -
Vancouver
Sanches PR. Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformatica [Internet]. 2006 ;[citado 2024 set. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-27112014-115821/ - Ferramentas computacionais para o estudo estrutural e funcional de genes de dermatófitos potencialmente envolvidos na patogenicidade
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